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Structure paper

タイトルStructure and gating mechanism of the α7 nicotinic acetylcholine receptor.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 184, Issue 8, Page 2121-2134.e13, Year 2021
掲載日2021年4月15日
著者Colleen M Noviello / Anant Gharpure / Nuriya Mukhtasimova / Rico Cabuco / Leah Baxter / Dominika Borek / Steven M Sine / Ryan E Hibbs /
PubMed 要旨The α7 nicotinic acetylcholine receptor plays critical roles in the central nervous system and in the cholinergic inflammatory pathway. This ligand-gated ion channel assembles as a homopentamer, is ...The α7 nicotinic acetylcholine receptor plays critical roles in the central nervous system and in the cholinergic inflammatory pathway. This ligand-gated ion channel assembles as a homopentamer, is exceptionally permeable to Ca, and desensitizes faster than any other Cys-loop receptor. The α7 receptor has served as a prototype for the Cys-loop superfamily yet has proven refractory to structural analysis. We present cryo-EM structures of the human α7 nicotinic receptor in a lipidic environment in resting, activated, and desensitized states, illuminating the principal steps in the gating cycle. The structures also reveal elements that contribute to its function, including a C-terminal latch that is permissive for channel opening, and an anionic ring in the extracellular vestibule that contributes to its high conductance and calcium permeability. Comparisons among the α7 structures provide a foundation for mapping the gating cycle and reveal divergence in gating mechanisms in the Cys-loop receptor superfamily.
リンクCell / PubMed:33735609 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.7 - 3.6 Å
構造データ

22979

7koo

EMDB-22979: Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to alpha-bungarotoxin in a resting state.
PDB-7koo: Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to alpha-bungarotoxin in a resting state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

22980

7koq

EMDB-22980, PDB-7koq:
Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine in a desensitized state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

22983

7kox

EMDB-22983, PDB-7kox:
Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and PNU-120596 in the activated state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.7 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

ChemComp-CA:
Unknown entry / カルシウムジカチオン

ChemComp-EPJ:
EPIBATIDINE / エピバチジン / alkaloid*YM

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • bungarus multicinctus (タイワンアマガサ)
  • escherichia coli (大腸菌)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / Cys-loop receptor

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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