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Structure paper

タイトルStructural and mechanistic insights into symmetry conversion in plant GORK K+ channel regulation.
ジャーナル・号・ページProtein Cell, Vol. 16, Issue 12, Page 1035-1047, Year 2025
掲載日2025年12月1日
著者Qi-Yu Li / Li Qin / Ling-Hui Tang / Chun-Rui Zhang / Shouguang Huang / Ke Wang / Gao-Hua Zhang / Ning-Jie Hao / Qian Xiao / Tongxin Niu / Min Su / Rainer Hedrich / Yu-Hang Chen /
PubMed 要旨GORK is a shaker-like potassium channel in plants that contains ankyrin (ANK) repeats. In guard cells, activation of GORK causes K+ efflux, reducing turgor pressure and closing stomata. However, how ...GORK is a shaker-like potassium channel in plants that contains ankyrin (ANK) repeats. In guard cells, activation of GORK causes K+ efflux, reducing turgor pressure and closing stomata. However, how GORK is regulated remains largely elusive. Here, we solved the cryo-EM structure of Arabidopsis GORK, revealing an unusual symmetry reduction (from C4 to C2) feature within its tetrameric assembly. This symmetry reduction in GORK channel is driven by ANK dimerization, which disrupts the coupling between transmembrane helices and cytoplasmic domains, thus maintaining GORK in an autoinhibited state. Electrophysiological and structural analyses further confirmed that ANK dimerization inhibits GORK, and its removal restores C4 symmetry, converting GORK to an activatable state. This dynamic switching between C2 and C4 symmetry, mediated by ANK dimerization, presents a GORK target site that guard cells regulate to switch the plant K+ channel between inhibited and activatable states, thus controlling stomatal movement in response to environmental stimuli.
リンクProtein Cell / PubMed:40996076 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.2 - 4.3 Å
構造データ

37500

8wfz

EMDB-37500, PDB-8wfz:
AtGORK Full length 2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.3 Å

62337

9khe

EMDB-62337, PDB-9khe:
AtGORK 1-623 truncated
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

62338

9khf

EMDB-62338, PDB-9khf:
AtGORK Full length 1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

62339

9khg

EMDB-62339, PDB-9khg:
AtGORK 1-510 truncated
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

化合物

ChemComp-K:
Unknown entry

由来
  • arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
キーワードTRANSPORT PROTEIN / Complex / Protein / PLANT PROTEIN / PROTON TRANSPORT

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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