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タイトルCryo-EM identifies F-ENA of Bacillus thuringiensis as a widespread family of endospore appendages across Firmicutes.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 16, Issue 1, Page 7652, Year 2025
掲載日2025年8月16日
著者Mike Sleutel / Adrià Sogues / Nani Van Gerven / Unni Lise Jonsmoen / Inge Van Molle / Marcus Fislage / Laurent Dirk Theunissen / Nathan F Bellis / Diana P Baquero / Edward H Egelman / Mart Krupovic / Fengbin Wang / Marina Aspholm / Han Remaut /
PubMed 要旨For over 100 years, Bacillus thuringiensis (Bt) has been used as an agricultural biopesticide to control pests caused by insect species in the orders of Lepidoptera, Diptera, and Coleoptera. Under ...For over 100 years, Bacillus thuringiensis (Bt) has been used as an agricultural biopesticide to control pests caused by insect species in the orders of Lepidoptera, Diptera, and Coleoptera. Under nutrient starvation, Bt cells differentiate into spores and associated toxin crystals that can adopt biofilm-like aggregates. We reveal that such Bt spore/toxin biofilms are embedded in a fibrous extrasporal matrix, and using cryoID, we resolved the structure and molecular identity of an uncharacterized type of pili, referred to here as Fibrillar ENdospore Appendages or F-ENA. F-ENA are monomolecular protein filaments anchored to the exosporium and tipped with a flexible fibrillum. Phylogenetic and structural analyses reveal that F-ENA are conserved in Bacilli and Clostridia, featuring head-neck domains with β-barrel necks that interlock via N-terminal hook peptides. In Bacillus, two collagen-like proteins (F-Anchor and F-BclA), respectively, tether F-ENA and form the distal tip. Sedimentation assays suggest F-ENA promotes spore clustering via F-BclA contacts and/or filament bundling.
リンクNat Commun / PubMed:40818982 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.23 - 4.1 Å
構造データ

48780

9n0b

EMDB-48780, PDB-9n0b:
Cryo-EM of spore appendage from Anaerovoracaceae
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.1 Å

52523

9hze

EMDB-52523, PDB-9hze:
CryoEM structure of F-ENA fibers on the spores of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.23 Å

52650

9i65

EMDB-52650, PDB-9i65:
Recombinant F-ENA-2 fibers
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.1 Å

由来
  • bacillota bacterium (バクテリア)
  • bacillus thuringiensis serovar kurstaki (バクテリア)
  • cohnella sp. ov330 (バクテリア)
キーワードPROTEIN FIBRIL / ENA / endospore appendage / protein fiber / helical / endospore appendage; ENA; helical; protein fiber; bacillus thuringiensis serovar kurstaki / spore appendage / helical filament / protein polymer

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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