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タイトルButyrolactol A enhances caspofungin efficacy via flippase inhibition in drug-resistant fungi.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 189, Issue 2, Page 620-639.e28, Year 2026
掲載日2026年1月22日
著者Xuefei Chen / H Diessel Duan / Michael J Hoy / Kalinka Koteva / Michaela Spitzer / Allison K Guitor / Emily Puumala / Aline A Fiebig / Guanggan Hu / Bonnie Yiu / Sommer Chou / Zhuyun Bian / Yeseul Choi / Amelia Bing Ya Guo / Wenliang Wang / Sheng Sun / Nicole Robbins / Anna Floyd Averette / Michael A Cook / Ray Truant / Lesley T MacNeil / Eric D Brown / James W Kronstad / Brian K Coombes / Leah E Cowen / Joseph Heitman / Huilin Li / Gerard D Wright /
PubMed 要旨Fungal infections cause millions of deaths annually and are challenging to treat due to limited therapeutic options and rising resistance. Cryptococci are intrinsically resistant to the latest ...Fungal infections cause millions of deaths annually and are challenging to treat due to limited therapeutic options and rising resistance. Cryptococci are intrinsically resistant to the latest generation of antifungals, echinocandins, while Candida auris, a notorious global threat, is also increasingly resistant. We performed a natural product screen to rescue caspofungin fungicidal activity against Cryptococcus neoformans H99 and identified butyrolactol A, which restores echinocandin efficacy against resistant fungal pathogens, including multidrug-resistant C. auris. Mode-of-action studies reveal that butyrolactol A inhibits the phospholipid flippase Apt1-Cdc50, blocking phospholipid transport. Cryo-electron microscopy analysis of the Apt1-butyrolactol A complex reveals that the flippase is trapped in a dead-end state. Apt1 inhibition disrupts membrane asymmetry, vesicular trafficking, and cytoskeletal organization, thereby enhancing echinocandin uptake and potency. This study identifies lipid flippases as promising antifungal targets and demonstrates the potential of revisiting natural products to expand the antifungal arsenal and combat resistance.
リンクCell / PubMed:41478284 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.95 - 3.27 Å
構造データ

47339

9dzv

EMDB-47339, PDB-9dzv:
Cryo-EM structure of the C. neoformans lipid flippase Apt1-Cdc50 in the E1 state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.27 Å

70618

9omv

EMDB-70618, PDB-9omv:
Cryo-EM structure of the C. neoformans lipid flippase Apt1-Cdc50 bound with butyrolactol A in the E2P state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.95 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

ChemComp-MG:
Unknown entry

ChemComp-BEF:
BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION

PDB-1bd6:
7-FE FERREDOXIN FROM BACILLUS SCHLEGELII, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE

由来
  • cryptococcus neoformans var. grubii h99 (菌類)
キーワードLIPID TRANSPORT / Cryptococcus neoformans / lipid flippase / P4-ATPase / Cdc50 protein / butyrolactol A / TRANSLOCASE/INHIBITOR / TRANSLOCASE-INHIBITOR complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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