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タイトルPNMA2 forms immunogenic non-enveloped virus-like capsids associated with paraneoplastic neurological syndrome.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 187, Issue 4, Page 831-845.e19, Year 2024
掲載日2024年2月15日
著者Junjie Xu / Simon Erlendsson / Manvendra Singh / G Aaron Holling / Matthew Regier / Iosune Ibiricu / Jenifer Einstein / Michael P Hantak / Gregory S Day / Amanda L Piquet / Tammy L Smith / Stacey L Clardy / Alexandra M Whiteley / Cédric Feschotte / John A G Briggs / Jason D Shepherd /
PubMed 要旨The paraneoplastic Ma antigen (PNMA) proteins are associated with cancer-induced paraneoplastic syndromes that present with an autoimmune response and neurological symptoms. Why PNMA proteins are ...The paraneoplastic Ma antigen (PNMA) proteins are associated with cancer-induced paraneoplastic syndromes that present with an autoimmune response and neurological symptoms. Why PNMA proteins are associated with this severe autoimmune disease is unclear. PNMA genes are predominantly expressed in the central nervous system and are ectopically expressed in some tumors. We show that PNMA2, which has been co-opted from a Ty3 retrotransposon, encodes a protein that is released from cells as non-enveloped virus-like capsids. Recombinant PNMA2 capsids injected into mice induce autoantibodies that preferentially bind external "spike" PNMA2 capsid epitopes, whereas a capsid-assembly-defective PNMA2 protein is not immunogenic. PNMA2 autoantibodies in cerebrospinal fluid of patients with anti-Ma2 paraneoplastic disease show similar preferential binding to spike capsid epitopes. PNMA2 capsid-injected mice develop learning and memory deficits. These observations suggest that PNMA2 capsids act as an extracellular antigen, capable of generating an autoimmune response that results in neurological deficits.
リンクCell / PubMed:38301645 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.2 - 3.3 Å
構造データ

19024

8rb3

EMDB-19024, PDB-8rb3:
Structure of the PNMA2 capsid
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

19025

8rb4

EMDB-19025, PDB-8rb4:
Structure of the five-fold capsomer of the PNMA2 capsid
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

19026

8rb5

EMDB-19026, PDB-8rb5:
Structure of the three-fold capsomer of the PNMA2 capsid
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

19027

8rb7

EMDB-19027, PDB-8rb7:
Structure of the two-fold capsomer of the PNMA2 capsid
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

由来
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードVIRUS LIKE PARTICLE / Endogenous retrovirus. PNMA2 / PNMA / Paraneoplastic syndrome / Paraneoplastic antigen Ma2 / VLP.

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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