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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Targeting cancer with small molecule pan-KRAS degraders
ジャーナル・号・ページ	Biorxiv, Year 2023
掲載日	2023年10月14日 (構造データの登録日)
著者	Popow J / Farnaby W / Gollner A / Kofink C / Fischer G / Wurm M / Zollman D / Wijaya A / Mischerikow N / Hasenoehrl C ...Popow J / Farnaby W / Gollner A / Kofink C / Fischer G / Wurm M / Zollman D / Wijaya A / Mischerikow N / Hasenoehrl C / Prokofeva P / Arnhof H / Arce-Solano S / Bell S / Boeck G / Diers E / Frost A / Goodwin-Tindall J / Karolyi-Oezguer J / Khan S / Klawatsch T / Koegl M / Kousek R / Kratochvil B / Kropatsch K / Lauber A / McLennan R / Olt S / Peter D / Petermann O / Roessler V / Stolt-Bergner P / Strack P / Strauss E / Trainor N / Vetma V / Whitworth C / Zhong S / Quant J / Weinstabl H / Kuster B / Ettmayer P / Ciulli A
リンク	Biorxiv / PubMedで検索
手法	EM (単粒子) / X線回折
解像度	1.56 - 3.5 Å
構造データ	18657 8qu8 EMDB-18657, PDB-8qu8: PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å PDB-8qug: KRAS-G12C in Complex with Compound 1 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.56 Å PDB-8qvu: Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.24 Å PDB-8qw6: Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å PDB-8qw7: Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.36 Å
化合物	ChemComp-ZN: Unknown entry ChemComp-GDP: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / GDP, エネルギー貯蔵分子YM / グアノシン二リン酸 ChemComp-WYL: (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-WYU: (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[2-[(2S)-2-methyl-1,4-diazepan-1-yl]pyrimidin-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト / リン酸塩 ChemComp-X4R: (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-X53*: (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide
由来	homo sapiens (ヒト)
キーワード	TRANSFERASE (転移酵素) / TARGETED PROTEIN DEGRADATION / PROTAC (タンパク質分解誘導キメラ分子) / GTPASE (GTPアーゼ) / KRAS (KRAS) / cancer (悪性腫瘍) / GENE REGULATION (遺伝子発現の調節) / Ternary Complex / Degrader / E3 ligase (ユビキチンリガーゼ) / Ligase (リガーゼ) / ONCOPROTEIN (がん遺伝子) / oncology (腫瘍学)