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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Leveraging Ligand Affinity and Properties: Discovery of Novel Benzamide-Type Cereblon Binders for the Design of PROTACs.
ジャーナル・号・ページ	J. Med. Chem., Vol. 66, Page 14513-14543, Year 2023
掲載日	2023年4月21日 (構造データの登録日)
著者	Steinebach, C. / Bricelj, A. / Murgai, A. / Sosic, I. / Bischof, L. / Ng, Y.L.D. / Heim, C. / Maiwald, S. / Proj, M. / Voget, R. ...Steinebach, C. / Bricelj, A. / Murgai, A. / Sosic, I. / Bischof, L. / Ng, Y.L.D. / Heim, C. / Maiwald, S. / Proj, M. / Voget, R. / Feller, F. / Kosmrlj, J. / Sapozhnikova, V. / Schmidt, A. / Zuleeg, M.R. / Lemnitzer, P. / Mertins, P. / Hansen, F.K. / Gutschow, M. / Kronke, J. / Hartmann, M.D.
リンク	J. Med. Chem. / PubMed:37902300
手法	X線回折
解像度	1.47 - 2.3 Å
構造データ	PDB-8ou3: Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 8d 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.47 Å PDB-8ou4: Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11a 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.25 Å PDB-8ou5: Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11b 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.3 Å PDB-8ou6: Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11c 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.84 Å PDB-8ou7: Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11d 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.7 Å PDB-8ou9: Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11e 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.75 Å PDB-8oua: Cereblon isoform 4 in complex with novel Benzamide-Type Cereblon Binder 11f 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.85 Å
化合物	ChemComp-ZN: Unknown entry ChemComp-EF2: S-Thalidomide / (S)-サリドマイド / 薬剤YM ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-W1T: 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-fluoranyl-benzamide ChemComp-HOH: WATER ChemComp-W2F: 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-chloranyl-benzamide ChemComp-W1X: 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-(trifluoromethyl)benzamide ChemComp-W26: 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-methyl-benzamide ChemComp-W1F: 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-methoxy-benzamide ChemComp-W1B: 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2-oxidanyl-benzamide ChemComp-W0Z*: 4-azanyl-~{N}-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-2,5-bis(fluoranyl)-3-methoxy-benzamide
由来	magnetospirillum gryphiswaldense (走磁性) magnetospirillum gryphiswaldense msr-1 v2 (走磁性)
キーワード	SIGNALING PROTEIN / Cereblon / PROTAC / E3 / molecular glue