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タイトルA pan-influenza antibody inhibiting neuraminidase via receptor mimicry.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 618, Issue 7965, Page 590-597, Year 2023
掲載日2023年5月31日
著者Corey Momont / Ha V Dang / Fabrizia Zatta / Kevin Hauser / Caihong Wang / Julia di Iulio / Andrea Minola / Nadine Czudnochowski / Anna De Marco / Kaitlin Branch / David Donermeyer / Siddhant Vyas / Alex Chen / Elena Ferri / Barbara Guarino / Abigail E Powell / Roberto Spreafico / Samantha S Yim / Dale R Balce / Istvan Bartha / Marcel Meury / Tristan I Croll / David M Belnap / Michael A Schmid / William Timothy Schaiff / Jessica L Miller / Elisabetta Cameroni / Amalio Telenti / Herbert W Virgin / Laura E Rosen / Lisa A Purcell / Antonio Lanzavecchia / Gyorgy Snell / Davide Corti / Matteo Samuele Pizzuto /
PubMed 要旨Rapidly evolving influenza A viruses (IAVs) and influenza B viruses (IBVs) are major causes of recurrent lower respiratory tract infections. Current influenza vaccines elicit antibodies ...Rapidly evolving influenza A viruses (IAVs) and influenza B viruses (IBVs) are major causes of recurrent lower respiratory tract infections. Current influenza vaccines elicit antibodies predominantly to the highly variable head region of haemagglutinin and their effectiveness is limited by viral drift and suboptimal immune responses. Here we describe a neuraminidase-targeting monoclonal antibody, FNI9, that potently inhibits the enzymatic activity of all group 1 and group 2 IAVs, as well as Victoria/2/87-like, Yamagata/16/88-like and ancestral IBVs. FNI9 broadly neutralizes seasonal IAVs and IBVs, including the immune-evading H3N2 strains bearing an N-glycan at position 245, and shows synergistic activity when combined with anti-haemagglutinin stem-directed antibodies. Structural analysis reveals that D107 in the FNI9 heavy chain complementarity-determinant region 3 mimics the interaction of the sialic acid carboxyl group with the three highly conserved arginine residues (R118, R292 and R371) of the neuraminidase catalytic site. FNI9 demonstrates potent prophylactic activity against lethal IAV and IBV infections in mice. The unprecedented breadth and potency of the FNI9 monoclonal antibody supports its development for the prevention of influenza illness by seasonal and pandemic viruses.
リンクNature / PubMed:37258672 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.2 - 3.1 Å
構造データ

29686

8g30

EMDB-29686, PDB-8g30:
N2 neuraminidase of A/Tanzania/205/2010 H3N2 in complex with 4 FNI19 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

29704

8g3m

EMDB-29704, PDB-8g3m:
N2 neuraminidase of A/Tanzania/205/2010 H3N2 in complex with 3 FNI9 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

29705

8g3n

EMDB-29705, PDB-8g3n:
N2 neuraminidase of A/Tanzania/205/2010 H3N2 in complex with 4 FNI9 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

29706

8g3o

EMDB-29706, PDB-8g3o:
N2 neuraminidase of A/Hong_Kong/2671/2019 in complex with 3 FNI9 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

29707

8g3p

EMDB-29707, PDB-8g3p:
N2 neuraminidase of A/Hong_Kong/2671/2019 in complex with 4 FNI9 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.5 Å

29708

8g3q

EMDB-29708, PDB-8g3q:
N2 neuraminidase of A/Tanzania/205/2010 H3N2 in complex with 3 FNI17 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.3 Å

29709

8g3r

EMDB-29709, PDB-8g3r:
N2 neuraminidase of A/Tanzania/205/2010 H3N2 with S245N S247T mutations in complex with one FNI17 Fab molecule
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.3 Å

29710

8g3v

EMDB-29710, PDB-8g3v:
N2 neuraminidase of A/Hong_Kong/2671/2019 in complex with 4 FNI19 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.2 Å

29711

8g3z

EMDB-29711, PDB-8g3z:
Neuraminidase of B/Massachusetts/02/2012 (Yamagata) in complex with 4 FNI17 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.3 Å

29712

8g40

EMDB-29712, PDB-8g40:
N2 neuraminidase of A/Hong_Kong/2671/2019 in complex with 3 FNI19 Fab molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

化合物

ChemComp-CA:
Unknown entry / カルシウムジカチオン

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

由来
  • influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • influenza b virus (B型インフルエンザウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / viral glycoprotein / antibody / Fab / influenza / virus / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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