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タイトルStructure of the Flight Muscle Thick Filament from the Bumble Bee, , at 6 Å Resolution.
ジャーナル・号・ページInt J Mol Sci, Vol. 24, Issue 1, Year 2022
掲載日2022年12月26日
著者Jiawei Li / Hamidreza Rahmani / Fatemeh Abbasi Yeganeh / Hosna Rastegarpouyani / Dianne W Taylor / Neil B Wood / Michael J Previs / Hiroyuki Iwamoto / Kenneth A Taylor /
PubMed 要旨Four insect orders have flight muscles that are both asynchronous and indirect; they are asynchronous in that the wingbeat frequency is decoupled from the frequency of nervous stimulation and ...Four insect orders have flight muscles that are both asynchronous and indirect; they are asynchronous in that the wingbeat frequency is decoupled from the frequency of nervous stimulation and indirect in that the muscles attach to the thoracic exoskeleton instead of directly to the wing. Flight muscle thick filaments from two orders, Hemiptera and Diptera, have been imaged at a subnanometer resolution, both of which revealed a myosin tail arrangement referred to as “curved molecular crystalline layers”. Here, we report a thick filament structure from the indirect flight muscles of a third insect order, Hymenoptera, the Asian bumble bee Bombus ignitus. The myosin tails are in general agreement with previous determinations from Lethocerus indicus and Drosophila melanogaster. The Skip 2 region has the same unusual structure as found in Lethocerus indicus thick filaments, an α-helix discontinuity is also seen at Skip 4, but the orientation of the Skip 1 region on the surface of the backbone is less angled with respect to the filament axis than in the other two species. The heads are disordered as in Drosophila, but we observe no non-myosin proteins on the backbone surface that might prohibit the ordering of myosin heads onto the thick filament backbone. There are strong structural similarities among the three species in their non-myosin proteins within the backbone that suggest how one previously unassigned density in Lethocerus might be assigned. Overall, the structure conforms to the previously observed pattern of high similarity in the myosin tail arrangement, but differences in the non-myosin proteins.
リンクInt J Mol Sci / PubMed:36613818 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度6.0 Å
構造データ

28208

8ew5

EMDB-28208: CryoEM map of myosin thick filament from Bombus ignitus asynchronous flight muscle
PDB-8ew5: The structure of flightin within myosin thick filaments from Bombus ignitus flight muscle
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.0 Å

由来
  • bombus ignitus (クロマルハナバチ)
キーワードSTRUCTURAL PROTEIN / Striated muscle / regulatory protein / myosin-binding protein

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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