[日本語] English
文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルStructural and mechanistic basis of substrate transport by the multidrug transporter MRP4.
ジャーナル・号・ページStructure, Vol. 31, Issue 11, Page 1407-11418.e6, Year 2023
掲載日2023年11月2日
著者Magnus Bloch / Isha Raj / Tillmann Pape / Nicholas M I Taylor /
PubMed 要旨Multidrug resistance-associated protein 4 (MRP4) is an ATP-binding cassette (ABC) transporter expressed at multiple tissue barriers where it actively extrudes a wide variety of drug compounds. ...Multidrug resistance-associated protein 4 (MRP4) is an ATP-binding cassette (ABC) transporter expressed at multiple tissue barriers where it actively extrudes a wide variety of drug compounds. Overexpression of MRP4 provides resistance to clinically used antineoplastic agents, making it a highly attractive therapeutic target for countering multidrug resistance. Here, we report cryo-EM structures of multiple physiologically relevant states of lipid bilayer-embedded human MRP4, including complexes between MRP4 and two widely used chemotherapeutic agents and a complex between MRP4 and its native substrate. The structures display clear similarities and distinct differences in the coordination of these chemically diverse substrates and, in combination with functional and mutational analysis, reveal molecular details of the transport mechanism. Our study provides key insights into the unusually broad substrate specificity of MRP4 and constitutes an important contribution toward a general understanding of multidrug transporters.
リンクStructure / PubMed:37683641
手法EM (単粒子)
解像度3.0 - 5.5 Å
構造データ

EMDB-16088, PDB-8bjf:
Cryo-EM structure of nanodisc-reconstituted wildtype human MRP4 (inward-facing conformation)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

EMDB-16292: Cryo-EM structure of nanodisc-reconstituted human MRP4 withE1202Q mutation (outward-facing occluded conformation)
PDB-8bwo: Cryo-EM structure of nanodisc-reconstituted human MRP4 with E1202Q mutation (outward-facing occluded conformation)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-16293, PDB-8bwp:
Cryo-EM structure of nanodisc-reconstituted wildtype human MRP4 (in complex with methotrexate)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-16294, PDB-8bwq:
Cryo-EM structure of nanodisc-reconstituted wildtype human MRP4 (in complex with topotecan)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.9 Å

EMDB-16295, PDB-8bwr:
Cryo-EM structure of nanodisc-reconstituted wildtype human MRP4 (in complex with prostaglandin E2)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

EMDB-16296: Cryo-EM structure of native nanodisc-reconstituted wildtype human MRP4 (inward-facing conformation) - no nucleotides/substrates added
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-16297: Cryo-EM structure of minimal nanodisc-reconstituted wildtype human MRP4 (inward-facing conformation) - no nucleotides/substrates added
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.5 Å

化合物

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル

ChemComp-Y01:
CHOLESTEROL HEMISUCCINATE / コレステリルヘミスクシナ-ト

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

ChemComp-MTX:
METHOTREXATE / メトトレキサ-ト / 化学療法薬*YM

ChemComp-TTC:
(S)-10-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]-4-ETHYL-4,9-DIHYDROXY-1H-PYRANO[3',4':6,7]INOLIZINO[1,2-B]-QUINOLINE-3,14(4H,12H)-DIONE / トポテカン / 薬剤, 阻害剤*YM

ChemComp-P2E:
(Z)-7-[(1R,2R,3R)-3-hydroxy-2-[(E,3S)-3-hydroxyoct-1-enyl]-5-oxo-cyclopentyl]hept-5-enoic acid / プロスタグランジンE2 / 薬剤*YM

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードTRANSLOCASE / ABC transporter / ABCC4 / MRP4 / Topotecan bound / PGE2 bound ABC transporter

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る