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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Calpeptin is a potent cathepsin inhibitor and drug candidate for SARS-CoV-2 infections.
ジャーナル・号・ページ	Commun Biol, Vol. 6, Page 1058-1058, Year 2023
掲載日	2021年12月10日 (構造データの登録日)
著者	Reinke, P.Y.A. / de Souza, E.E. / Gunther, S. / Falke, S. / Lieske, J. / Ewert, W. / Loboda, J. / Herrmann, A. / Rahmani Mashhour, A. / Karnicar, K. ...Reinke, P.Y.A. / de Souza, E.E. / Gunther, S. / Falke, S. / Lieske, J. / Ewert, W. / Loboda, J. / Herrmann, A. / Rahmani Mashhour, A. / Karnicar, K. / Usenik, A. / Lindic, N. / Sekirnik, A. / Botosso, V.F. / Santelli, G.M.M. / Kapronezai, J. / de Araujo, M.V. / Silva-Pereira, T.T. / Filho, A.F.S. / Tavares, M.S. / Florez-Alvarez, L. / de Oliveira, D.B.L. / Durigon, E.L. / Giaretta, P.R. / Heinemann, M.B. / Hauser, M. / Seychell, B. / Bohler, H. / Rut, W. / Drag, M. / Beck, T. / Cox, R. / Chapman, H.N. / Betzel, C. / Brehm, W. / Hinrichs, W. / Ebert, G. / Latham, S.L. / Guimaraes, A.M.S. / Turk, D. / Wrenger, C. / Meents, A.
リンク	Commun Biol / PubMed:37853179
手法	X線回折
解像度	1.3 - 2 Å
構造データ	PDB-7qgw: Sulfonated Calpeptin is a promising drug candidate against SARS-CoV-2 infections 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.3 Å PDB-7qka: Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with covalently bound GC376 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.8 Å PDB-7qkb: Crystal structure of human Cathepsin L in complex with covalently bound GC376 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.8 Å PDB-7qkc: Crystal structure of human Cathepsin L after incubation with Sulfo-Calpeptin 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.69 Å PDB-7z3t: Crystal structure of apo human Cathepsin L 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.6 Å PDB-7z3u: Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease after incubation with Sulfo-Calpeptin 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.72 Å PDB-7z58: Crystal structure of human Cathepsin L in complex with covalently bound Calpeptin 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.35 Å PDB-8c3d: Sulfonated Calpeptin is a promising drug candidate against SARS-CoV-2 infections 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2 Å
化合物	ChemComp-CL: Unknown entry / クロリド ChemComp-MPD: (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL / (S)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-RN2: Calpeptin ChemComp-HOH: WATER ChemComp-DMS: DIMETHYL SULFOXIDE / 2-チアプロパン2-オキシド / DMSO, 沈殿剤YM ChemComp-UED: N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide ChemComp-PEG: DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル ChemComp-NA: Unknown entry / ナトリウムカチオン ChemComp-PGE: TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル ChemComp-PG4: TETRAETHYLENE GLYCOL / テトラエチレングリコ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-P6G: HEXAETHYLENE GLYCOL / ヘキサエチレングリコ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-1PE: PENTAETHYLENE GLYCOL / ペンタエチレングリコ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-CA*: Unknown entry / カルシウムジカチオン
由来	homo sapiens (ヒト) severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス) synthetic construct (人工物)
キーワード	HYDROLASE / cathepsin / inhibitor / main protease / MPro / cystein protease / drug development / drug target / peptide-like inhibitor / SARS-CoV-2 / COVID-19 / lysosome / protein degradation / spike protein maturation