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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Fragment screening and structural analyses highlight the ATP-assisted ligand binding for inhibitor discovery against type 1 methionyl-tRNA synthetase.
ジャーナル・号・ページ	Nucleic Acids Res., Vol. 50, Page 4755-4768, Year 2022
掲載日	2022年1月24日 (構造データの登録日)
著者	Yi, J. / Cai, Z. / Qiu, H. / Lu, F. / Luo, Z. / Chen, B. / Gu, Q. / Xu, J. / Zhou, H.
リンク	Nucleic Acids Res. / PubMed:35474479
手法	X線回折
解像度	1.92 - 2.8 Å
構造データ	PDB-7wpi: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with a phenylbenzimidazole inhibitor 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.92 Å PDB-7wpj: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.65 Å PDB-7wpk: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with L-Met 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.8 Å PDB-7wpl: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.5 Å PDB-7wpm: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with a fragment and ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.8 Å PDB-7wpn: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with a phenylbenzimidazole inhibitor and ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.4 Å PDB-7wpt: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with a fragment M2-80 and ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.26 Å PDB-7wpx: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with a fragment and ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.4 Å PDB-7wq0: Methionyl-tRNA synthetase from Staphylococcus aureus complexed with a fragment and ATP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.09 Å
化合物	ChemComp-1V7: 2-(4-bromanyl-3-oxidanyl-phenyl)-1-[(1R)-2-[2-(2-tert-butylphenoxy)ethanoylamino]-1-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl]-N-methyl-benzimidazole-5-carboxamide ChemComp-ACT: ACETATE ION / 酢酸イオン ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-HOH: WATER ChemComp-MET: METHIONINE / メチオニン ChemComp-ATP: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子YM ChemComp-2AQ: QUINOLIN-2-AMINE / 2-アミノキノリン ChemComp-29I: (phenylmethyl) N-[(2R)-2-[2-(4-bromanyl-3-oxidanyl-phenyl)-5-(methylcarbamoyl)benzimidazol-1-yl]-2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl]carbamate ChemComp-ACY: ACETIC ACID / 酢酸 ChemComp-XM0: INDAN-2-AMINE / 2-アミノインダン ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-2I3: 6-chloranylimidazo[2,1-b][1,3]thiazole ChemComp-TPA*: TRANS-2-PHENYLCYCLOPROPYLAMINE
由来	staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌) staphylococcus aureus subsp. aureus col (黄色ブドウ球菌)
キーワード	LIGASE/INHIBITOR / Inhibitor / LIGASE / LIGASE-INHIBITOR complex