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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Development of optimized drug-like small molecule inhibitors of the SARS-CoV-2 3CL protease for treatment of COVID-19.
ジャーナル・号・ページ	Nat Commun, Vol. 13, Page 1891-1891, Year 2022
掲載日	2022年1月13日 (構造データの登録日)
著者	Liu, H. / Iketani, S. / Zask, A. / Khanizeman, N. / Bednarova, E. / Forouhar, F. / Fowler, B. / Hong, S.J. / Mohri, H. / Nair, M.S. ...Liu, H. / Iketani, S. / Zask, A. / Khanizeman, N. / Bednarova, E. / Forouhar, F. / Fowler, B. / Hong, S.J. / Mohri, H. / Nair, M.S. / Huang, Y. / Tay, N.E.S. / Lee, S. / Karan, C. / Resnick, S.J. / Quinn, C. / Li, W. / Shion, H. / Xia, X. / Daniels, J.D. / Bartolo-Cruz, M. / Farina, M. / Rajbhandari, P. / Jurtschenko, C. / Lauber, M.A. / McDonald, T. / Stokes, M.E. / Hurst, B.L. / Rovis, T. / Chavez, A. / Ho, D.D. / Stockwell, B.R.
リンク	Nat Commun / PubMed:35393402
手法	X線回折
解像度	1.55 - 2.17 Å
構造データ	PDB-7tia: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor NK01-14 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.64 Å PDB-7tiu: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor EB46 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.65 Å PDB-7tiv: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor EB48 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.08 Å PDB-7tiw: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor EB54 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.68 Å PDB-7tix: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor EB56 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.0 Å PDB-7tiy: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor NK01-48 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.79 Å PDB-7tiz: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor NK01-63 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.55 Å PDB-7tj0: Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in complex with inhibitor SL-4-241 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.17 Å
化合物	ChemComp-XTP: benzyl [(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]carbamate ChemComp-SCN: THIOCYANATE ION / チオシアン酸アニオン ChemComp-HOH: WATER ChemComp-V46: (1S,2S)-2-[(N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-W48: (1S,2S)-2-[(N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-3-cyclohexyl-L-alanyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl]propane-1-sulfonic acid ChemComp-I54: (1S,2S)-2-[(N-{[(2-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid ChemComp-Q56: N~2~-{[(naphthalen-2-yl)methoxy]carbonyl}-N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide ChemComp-Y48: (1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-[(N-{[(2,4,5-trifluorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]propane-1-sulfonic acid ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-N63: (1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-{[N-({[3-(trifluoromethyl)phenyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}propane-1-sulfonic acid ChemComp-NA: Unknown entry / ナトリウムカチオン ChemComp-S4L: (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-cyclohexyl-L-alanyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid ChemComp-ACT: ACETATE ION / 酢酸イオン
由来	severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)
キーワード	VIRAL PROTEIN/INHIBITOR / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-INHIBITOR complex