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タイトルStructures of full-length glycoprotein hormone receptor signalling complexes.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 598, Issue 7882, Page 688-692, Year 2021
掲載日2021年9月22日
著者Jia Duan / Peiyu Xu / Xi Cheng / Chunyou Mao / Tristan Croll / Xinheng He / Jingjing Shi / Xiaodong Luan / Wanchao Yin / Erli You / Qiufeng Liu / Shuyang Zhang / Hualiang Jiang / Yan Zhang / Yi Jiang / H Eric Xu /
PubMed 要旨Luteinizing hormone and chorionic gonadotropin are glycoprotein hormones that are related to follicle-stimulating hormone and thyroid-stimulating hormone. Luteinizing hormone and chorionic ...Luteinizing hormone and chorionic gonadotropin are glycoprotein hormones that are related to follicle-stimulating hormone and thyroid-stimulating hormone. Luteinizing hormone and chorionic gonadotropin are essential to human reproduction and are important therapeutic drugs. They activate the same G-protein-coupled receptor, luteinizing hormone-choriogonadotropin receptor (LHCGR), by binding to the large extracellular domain. Here we report four cryo-electron microscopy structures of LHCGR: two structures of the wild-type receptor in the inactive and active states; and two structures of the constitutively active mutated receptor. The active structures are bound to chorionic gonadotropin and the stimulatory G protein (G), and one of the structures also contains Org43553, an allosteric agonist. The structures reveal a distinct 'push-and-pull' mechanism of receptor activation, in which the extracellular domain is pushed by the bound hormone and pulled by the extended hinge loop next to the transmembrane domain. A highly conserved 10-residue fragment (P10) from the hinge C-terminal loop at the interface between the extracellular domain and the transmembrane domain functions as a tethered agonist to induce conformational changes in the transmembrane domain and G-protein coupling. Org43553 binds to a pocket of the transmembrane domain and interacts directly with P10, which further stabilizes the active conformation. Together, these structures provide a common model for understanding the signalling of glycoprotein hormone receptors and a basis for drug discovery for endocrine diseases.
リンクNature / PubMed:34552239
手法EM (単粒子)
解像度3.2 - 4.3 Å
構造データ

31596

7fig

EMDB-31596, PDB-7fig:
luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor(S277I)-chorionic gonadotropin-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.9 Å

31597

7fih

EMDB-31597, PDB-7fih:
luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor(S277I)-chorionic gonadotropin-Gs-Org43553 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

31598

7fii

EMDB-31598, PDB-7fii:
luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor-chorionic gonadotropin-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.3 Å

31599

7fij

EMDB-31599, PDB-7fij:
luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

ChemComp-55Z:
5-azanyl-N-tert-butyl-2-methylsulfanyl-4-[3-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)phenyl]thieno[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide / Org-43553

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • bos taurus (ウシ)
  • lama glama (ラマ)
  • rattus norvegicus (ドブネズミ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / glycoprotein hormone receptor / luteinizing hormone / chorionic gonadotropin / GPCR / Gs-protein / choriogonadotropin receptor

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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