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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Structural basis for guide RNA trimming by RNase D ribonuclease in Trypanosoma brucei.
ジャーナル・号・ページ	Nucleic Acids Res., Vol. 49, Page 568-583, Year 2021
掲載日	2020年5月14日 (構造データの登録日)
著者	Gao, Y. / Liu, H. / Zhang, C. / Su, S. / Chen, Y. / Chen, X. / Li, Y. / Shao, Z. / Zhang, Y. / Shao, Q. ...Gao, Y. / Liu, H. / Zhang, C. / Su, S. / Chen, Y. / Chen, X. / Li, Y. / Shao, Z. / Zhang, Y. / Shao, Q. / Li, J. / Huang, Z. / Ma, J. / Gan, J.
リンク	Nucleic Acids Res. / PubMed:33332555
手法	X線回折
解像度	1.769 - 2.3 Å
構造データ	PDB-7c42: The crystal structure of Trypanosoma brucei RNase D 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2 Å PDB-7c43: The crystal structure of Trypanosoma brucei RNase D : AMP complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.3 Å PDB-7c45: The crystal structure of Trypanosoma brucei RNase D complex with RNA U12 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.769 Å PDB-7c47: The crystal structure of Trypanosoma brucei RNase D : CMP complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å PDB-7c4b: The crystal structure of Trypanosoma brucei RNase D : UMP complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.101 Å PDB-7c4c: The crystal structure of Trypanosoma brucei RNase D : GMP complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.265 Å
化合物	ChemComp-ZN: Unknown entry ChemComp-HOH: WATER ChemComp-MN: Unknown entry ChemComp-AMP: ADENOSINE MONOPHOSPHATE / AMP / AMPYM ChemComp-CA: Unknown entry / カルシウムジカチオン ChemComp-C5P: CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE / CMP ChemComp-U5P: URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE / UMP ChemComp-5GP*: GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / GMP
由来	trypanosoma brucei brucei (strain 927/4 gutat10.1) (トリパノソーマ) synthetic construct (人工物)
キーワード	HYDROLASE / Trypanosoma brucei / RNase D / guide RNA degradation / RNA BINDING PROTEIN / AMP / RNA BINDING PROTEIN/RNA / RNA U12 / RNA BINDING PROTEIN-RNA complex / CMP / UMP / GMP