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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Structural Insights into Plasticity and Discovery of Remdesivir Metabolite GS-441524 Binding in SARS-CoV-2 Macrodomain.
ジャーナル・号・ページ	Acs Med. Chem. Lett., Vol. 12, Page 603-609, Year 2021
掲載日	2020年4月29日 (構造データの登録日)
著者	Ni, X. / Schroder, M. / Olieric, V. / Sharpe, M.E. / Hernandez-Olmos, V. / Proschak, E. / Merk, D. / Knapp, S. / Chaikuad, A.
リンク	Acs Med. Chem. Lett. / PubMed:33850605
手法	X線回折
解像度	1.55 - 2.5 Å
構造データ	PDB-6ywk: Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å PDB-6ywl: Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.5 Å PDB-6ywm: Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with MES 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.16 Å PDB-7bf3: Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.0 Å PDB-7bf4: Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with GMP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.55 Å PDB-7bf5: Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å PDB-7bf6: Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with remdesivir metabolite GS-441524 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.15 Å
化合物	ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-EPE: 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID / HEPES / pH緩衝剤YM / HEPES ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-APR: ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE ChemComp-MES: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸 / pH緩衝剤YM / MES (緩衝剤) ChemComp-ADN: ADENOSINE / アデノシン / アデノシン ChemComp-5GP: GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / GMP / グアニル酸 ChemComp-A2R: [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE / ADPRP ChemComp-U08: (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile / 抗ウイルス剤*YM / GS-441524
由来	severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARSコロナウイルス2)
キーワード	VIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / NSP3 / macrodomain / ADP-ribose-1"-phosphatase / ADRP / Covid-19 (新型コロナウイルス感染症 (2019年)) / SARS-COV-2 (SARSコロナウイルス2) / Structural Genomics (構造ゲノミクス) / Structural Genomics Consortium / SGC / ADP-ribose (ADPリボース) / adenosine (アデノシン) / GMP / guanosine monophosphate (グアニル酸) / ADP-ribose-phosphate / ADPRP / remdesivir (レムデシビル) / GS-441524