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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	BAF complex vulnerabilities in cancer demonstrated via structure-based PROTAC design.
ジャーナル・号・ページ	Nat. Chem. Biol., Vol. 15, Page 672-680, Year 2019
掲載日	2018年8月9日 (構造データの登録日)
著者	Farnaby, W. / Koegl, M. / Roy, M.J. / Whitworth, C. / Diers, E. / Trainor, N. / Zollman, D. / Steurer, S. / Karolyi-Oezguer, J. / Riedmueller, C. ...Farnaby, W. / Koegl, M. / Roy, M.J. / Whitworth, C. / Diers, E. / Trainor, N. / Zollman, D. / Steurer, S. / Karolyi-Oezguer, J. / Riedmueller, C. / Gmaschitz, T. / Wachter, J. / Dank, C. / Galant, M. / Sharps, B. / Rumpel, K. / Traxler, E. / Gerstberger, T. / Schnitzer, R. / Petermann, O. / Greb, P. / Weinstabl, H. / Bader, G. / Zoephel, A. / Weiss-Puxbaum, A. / Ehrenhofer-Wolfer, K. / Wohrle, S. / Boehmelt, G. / Rinnenthal, J. / Arnhof, H. / Wiechens, N. / Wu, M.Y. / Owen-Hughes, T. / Ettmayer, P. / Pearson, M. / McConnell, D.B. / Ciulli, A.
リンク	Nat. Chem. Biol. / PubMed:31178587
手法	X線回折
解像度	1.31 - 2.35 Å
構造データ	PDB-6hax: Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.35 Å PDB-6hay: Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.24 Å PDB-6haz: Crystal structure of the bromodomain of human SMARCA2 in complex with SMARCA-BD ligand 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.31 Å PDB-6hr2: Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.76 Å
化合物	ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール ChemComp-FWZ: (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-EPE: 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID / HEPES / pH緩衝剤YM / HEPES ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-FX8: (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-FMT: FORMIC ACID / ギ酸 / ギ酸 ChemComp-FX5: 2-(6-azanyl-5-piperazin-4-ium-1-yl-pyridazin-3-yl)phenol ChemComp-ZN: Unknown entry ChemComp-DMS: DIMETHYL SULFOXIDE / 2-チアプロパン2-オキシド / DMSO, 沈殿剤YM / ジメチルスルホキシド
由来	homo sapiens (ヒト)
キーワード	GENE REGULATION (遺伝子発現の調節) / bromodomain (ブロモドメイン) / E3 Ubiquitin Protein Ligase / TRANSCRIPTION (転写 (生物学)) / BRG1 (SMARCA4) / SMARCA4 (SMARCA4) / PROTAC (タンパク質分解誘導キメラ分子) / VHL / ternary complex