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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Lysyl-tRNA synthetase as a drug target in malaria and cryptosporidiosis.
ジャーナル・号・ページ	Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., Year 2019
掲載日	2015年11月4日 (構造データの登録日)
著者	Baragana, B. / Forte, B. / Choi, R. / Nakazawa Hewitt, S. / Bueren-Calabuig, J.A. / Pisco, J.P. / Peet, C. / Dranow, D.M. / Robinson, D.A. / Jansen, C. ...Baragana, B. / Forte, B. / Choi, R. / Nakazawa Hewitt, S. / Bueren-Calabuig, J.A. / Pisco, J.P. / Peet, C. / Dranow, D.M. / Robinson, D.A. / Jansen, C. / Norcross, N.R. / Vinayak, S. / Anderson, M. / Brooks, C.F. / Cooper, C.A. / Damerow, S. / Delves, M. / Dowers, K. / Duffy, J. / Edwards, T.E. / Hallyburton, I. / Horst, B.G. / Hulverson, M.A. / Ferguson, L. / Jimenez-Diaz, M.B. / Jumani, R.S. / Lorimer, D.D. / Love, M.S. / Maher, S. / Matthews, H. / McNamara, C.W. / Miller, P. / O'Neill, S. / Ojo, K.K. / Osuna-Cabello, M. / Pinto, E. / Post, J. / Riley, J. / Rottmann, M. / Sanz, L.M. / Scullion, P. / Sharma, A. / Shepherd, S.M. / Shishikura, Y. / Simeons, F.R.C. / Stebbins, E.E. / Stojanovski, L. / Straschil, U. / Tamaki, F.K. / Tamjar, J. / Torrie, L.S. / Vantaux, A. / Witkowski, B. / Wittlin, S. / Yogavel, M. / Zuccotto, F. / Angulo-Barturen, I. / Sinden, R. / Baum, J. / Gamo, F.J. / Maser, P. / Kyle, D.E. / Winzeler, E.A. / Myler, P.J. / Wyatt, P.G. / Floyd, D. / Matthews, D. / Striepen, B. / Huston, C.D. / Gray, D.W. / Fairlamb, A.H. / Pisliakov, A.V. / Walpole, C. / Read, K.D. / Van Voorhis, W.C. / Gilbert, I.H.
リンク	Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. / PubMed:30894487
手法	X線回折
解像度	1.46 - 2.2 Å
構造データ	PDB-5eln: Crystal Structure of Lysyl-tRNA Synthetase from Cryptosporidium parvum complexed with L-lysine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å PDB-5elo: Crystal Structure of Lysyl-tRNA Synthetase from Cryptosporidium parvum complexed with L-lysine and cladosporin 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å PDB-6agt: Crystal structure of PfKRS complexed with chromone inhibitor 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.953 Å PDB-6hcu: Crystal Structure of Lysyl-tRNA Synthetase from Plasmodium falciparum bound to a difluoro cyclohexyl chromone ligand 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.62 Å PDB-6hcv: Crystal Structure of Lysyl-tRNA Synthetase from Plasmodium falciparum complexed with a chromone ligand 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å PDB-6hcw: Crystal Structure of Lysyl-tRNA Synthetase from Cryptosporidium parvum complexed with L-lysine and a difluoro cyclohexyl chromone ligand 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.46 Å
化合物	ChemComp-LYS: LYSINE / 2-アンモニオ-2-デアミノ-L-リシン ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-HOH: WATER ChemComp-KRS: cladosporin / クラドスポリン ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン ChemComp-9X0: N-(cyclohexylmethyl)-4-oxo-4H-1-benzopyran-2-carboxamide ChemComp-CO: Unknown entry ChemComp-FMT: FORMIC ACID / ギ酸 ChemComp-MLA: MALONIC ACID / マロン酸 ChemComp-FYB: ~{N}-[[4,4-bis(fluoranyl)-1-oxidanyl-cyclohexyl]methyl]-6-fluoranyl-4-oxidanylidene-chromene-2-carboxamide ChemComp-PEG: DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル ChemComp-HIS: HISTIDINE / ヒスチジン-N^α,3-ジカチオン ChemComp-TRS: 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL / トリス(ヒドロキシメチル)メチルアンモニウム / pH緩衝剤YM ChemComp-FYE*: 6-fluoranyl-~{N}-[(1-oxidanylcyclohexyl)methyl]-4-oxidanylidene-chromene-2-carboxamide
由来	cryptosporidium parvum (strain iowa ii) (小形クリプトスポリジウム) plasmodium falciparum (マラリア病原虫) plasmodium falciparum 3d7 (マラリア病原虫)
キーワード	LIGASE / SSGCID / Lysine--tRNA ligase / Cryptosporidium parvum / ATP binding / aminoacylation / Structural Genomics / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease / ligase/ligase inhibitor / cladosporin / ligase-ligase inhibitor complex / LIGASE/INHIBITOR / KRS / CHROMONE INHIBITOR / ATP BINDING PROTEIN / LIGASE-INHIBITOR COMPLEX / TRANSFERASE / ADENYLYLTRANSFERASE ACTIVITY / TRNA BINDING