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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Identification of an auxiliary druggable pocket in the DNA gyrase ATPase domain using fragment probes
ジャーナル・号・ページ	Medchemcomm, Vol. 9, Page 1619-1629, Year 2018
掲載日	2018年1月11日 (構造データの登録日)
著者	Huang, X. / Guo, J. / Liu, Q. / Gu, Q. / Xu, J. / Zhou, H.
リンク	Medchemcomm / PubMed:30429968
手法	X線回折
解像度	1.45 - 2.74 Å
構造データ	PDB-5z4h: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.0 Å PDB-5z4o: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.73 Å PDB-5z9b: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with (3,4-dichlorophenyl)hydrazine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.1 Å PDB-5z9e: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.8 Å PDB-5z9f: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.76 Å PDB-5z9l: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.6 Å PDB-5z9m: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.74 Å PDB-5z9n: S.aureus GyrB ATPase domain in complex with 4,6-dichloro-2-(methylthio)pyrimidine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.54 Å PDB-5z9p: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.45 Å PDB-5z9q: Bacterial GyrB ATPase domain in complex with a chemical fragment 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.8 Å
化合物	ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-A8K: 4-(4-hydroxyphenyl)sulfanylphenol / 4,4′-チオビスフェノ-ル ChemComp-AX7: 1H-benzimidazol-2-amine / 2-アミノベンゾイミダゾ-ル ChemComp-HOH: WATER ChemComp-HX8: 4-phenoxyphenol / 4-フェノキシフェノ-ル ChemComp-HX3: (3,4-dichlorophenyl)hydrazine / 3,4-ジクロロフェニルヒドラジン ChemComp-27K: butyl 4-hydroxybenzoate / ブチルパラベン ChemComp-0R0: 2-hydroxybenzonitrile / 2-ヒドロキシベンゾニトリル ChemComp-8H8: 2-fluoro-4-hydroxybenzonitrile / 3-フルオロ-4-シアノフェノ-ル ChemComp-BZ2: 1-benzofuran-2-carboxylic acid / ベンゾフラン-2-カルボン酸 ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン ChemComp-HX5: 4,6-dichloro-2-(methylsulfanyl)pyrimidine / 2-(メチルチオ)-4,6-ジクロロピリミジン ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-HX4: 5-phenyl-1H-pyrazol-3-amine / 3-アミノ-5-フェニル-1H-ピラゾ-ル
由来	escherichia coli (strain k12) (大腸菌) escherichia coli k-12 (大腸菌) staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
キーワード	ISOMERASE / DNA Topoisomerase / Antibacterial / Drug Target / Fragment-base Lead Discovery