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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Biochemical and structural studies of Mycobacterium smegmatis MutT1, a sanitization enzyme with unusual modes of association
ジャーナル・号・ページ	Acta Crystallogr D Struct Biol, Vol. 73, Page 349-364, Year 2017
掲載日	2016年6月15日 (構造データの登録日)
著者	Arif, S.M. / Patil, A.G. / Varshney, U. / Vijayan, M.
リンク	Acta Crystallogr D Struct Biol / PubMed:28375146
手法	X線回折
解像度	1.1 - 1.85 Å
構造データ	PDB-5gg5: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.64 Å PDB-5gg6: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with 8-oxo-dGTP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.75 Å PDB-5gg7: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with 8-oxo-dGTP, 8-oxo-dGMP and pyrophosphate (I) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.7 Å PDB-5gg8: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with 8-oxo-dGTP, 8-oxo-dGMP and pyrophosphate (II) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.85 Å PDB-5gg9: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with 8-oxo-GTP, 8-oxo-GMP and pyrophosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.6 Å PDB-5gga: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with 8-oxo-GDP, 8-oxo-GMP and pyrophosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.75 Å PDB-5ggb: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with 8-oxo-dGDP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.1 Å PDB-5ggc: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with phosphate and magnesium ions (excess magnesium, I) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.85 Å PDB-5ggd: Crystal structure of Mycobacterium smegmatis MutT1 in complex with phosphate and magnesium ions (excess magnesium, II) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.7 Å
化合物	ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-PEG: DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル ChemComp-HOH: WATER ChemComp-8DG: 8-OXO-2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / 8-オキソdGTP ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-CL: Unknown entry / クロリド ChemComp-8OG: 8-OXO-2'-DEOXY-GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / 8-オキソ-dGMP ChemComp-POP: PYROPHOSPHATE 2- ChemComp-8GT: 8-OXO-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / 8-オキソ-GTP ChemComp-8GM: [(2R,3S,4R,5R)-5-[2-azanyl-6,8-bis(oxidanylidene)-1,7-dihydropurin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate / 8-オキソ-GMP ChemComp-G8D: [(2R,3S,4R,5R)-5-[2-azanyl-6,8-bis(oxidanylidene)-1,7-dihydropurin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono / 8-oxo-GDP ChemComp-8GD: 2'-deoxy-8-oxoguanosine 5'-(trihydrogen diphosphate) / 8-オキソ-dGDP ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト
由来	mycobacterium smegmatis str. mc2 155 (バクテリア)
キーワード	HYDROLASE / 8-oxo-guanine nucleotides / sanitization of nucleotide pool / nudix enzyme / histidine phosphatase domain / binding sites at intermolecular interface / enzyme action