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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Carbon-sulfur bond-forming reaction catalysed by the radical SAM enzyme HydE.
ジャーナル・号・ページ	Nat. Chem., Vol. 8, Page 491-500, Year 2016
掲載日	2015年12月17日 (構造データの登録日)
著者	Rohac, R. / Amara, P. / Benjdia, A. / Martin, L. / Ruffie, P. / Favier, A. / Berteau, O. / Mouesca, J.M. / Fontecilla-Camps, J.C. / Nicolet, Y.
リンク	Nat. Chem. / PubMed:27102684
手法	X線回折
解像度	1.17 - 1.49 Å
構造データ	PDB-5fep: HydE from T. maritima in complex with (2R,4R)-MeTDA 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.45 Å PDB-5fes: HydE from T. maritima in complex with (2R,4R)-MeSeTDA 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.27 Å PDB-5few: HydE from T. maritima in complex with S-adenosyl-L-cysteine (final product) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.17 Å PDB-5fex: HydE from T. maritima in complex with Se-adenosyl-L-selenocysteine (tfinal of the reaction) 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.32 Å PDB-5fez: HydE from T. maritima in complex with (2R,4R)-MeSeTDA, 5'-deoxyadenosine and methionine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.35 Å PDB-5ff0: HydE from T. maritima in complex with S-adenosyl-L-cysteine and methionine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.49 Å PDB-5ff2: HydE from T. maritima in complex with (2R,4R)-TDA 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.47 Å PDB-5ff3: HydE from T. maritima in complex with 4R-TCA 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.18 Å PDB-5ff4: HydE from T. maritima in complex with (2R,4R)-TMeTDA 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.35 Å
化合物	ChemComp-SF4: IRON/SULFUR CLUSTER / 鉄・硫黄クラスター ChemComp-CPS: 3-[(3-CHOLAMIDOPROPYL)DIMETHYLAMMONIO]-1-PROPANESULFONATE / 可溶化剤YM / CHAPS detergent ChemComp-SAM: S-ADENOSYLMETHIONINE / S-アデノシルメチオニン ChemComp-CL: Unknown entry / クロリド / 塩化物 ChemComp-41K: (2R,4R)-2-methyl-1,3-thiazolidine-2,4-dicarboxylic acid ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-9SE: (2~{R},4~{R})-2-methyl-1,3-selenazolidine-2,4-dicarboxylic acid ChemComp-MET: METHIONINE / メチオニン / メチオニン ChemComp-5X8: S-adenosyl-L-cysteine / S-(5′-アデノシル)システイン ChemComp-SAH: S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE / S-アデノシルホモシステイン / S-アデノシル-L-ホモシステイン ChemComp-5AD: 5'-DEOXYADENOSINE / 5′-デオキシアデノシン / デオキシアデノシン ChemComp-SEC: SELENOCYSTEINE / セレノシステイン / セレノシステイン ChemComp-SFS: Fe4-Se4 cluster ChemComp-5XB: (2~{R},4~{R})-1,3-thiazolidine-2,4-dicarboxylic acid / チアゾリジン-2α,4α-ジカルボン酸 ChemComp-H2S: HYDROSULFURIC ACID / 硫化水素 / 硫化水素 ChemComp-FES: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / 鉄・硫黄クラスター ChemComp-PRS: THIOPROLINE / L-チオプロリン ChemComp-5ZZ: (2~{R},4~{R})-2,5,5-trimethyl-1,3-thiazolidine-2,4-dicarboxylic acid ChemComp-SE*: SELENIUM ATOM / セレン化水素 / セレン化水素
由来	thermotoga maritima (テルモトガ・マリティマ) thermotoga maritima (strain atcc 43589 / msb8 / dsm 3109 / jcm 10099) (テルモトガ・マリティマ)
キーワード	OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / Radical SAM enzyme / complex / FeFe-hydrogenase maturase / thiazolidine (チアゾリジン) / thazolidine