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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Streptococcus pneumoniae NanC: STRUCTURAL INSIGHTS INTO THE SPECIFICITY AND MECHANISM OF A SIALIDASE THAT PRODUCES A SIALIDASE INHIBITOR.
ジャーナル・号・ページ	J. Biol. Chem., Vol. 290, Page 27736-27748, Year 2015
掲載日	2015年3月20日 (構造データの登録日)
著者	Owen, C.D. / Lukacik, P. / Potter, J.A. / Sleator, O. / Taylor, G.L. / Walsh, M.A.
リンク	J. Biol. Chem. / PubMed:26370075
手法	X線回折
解像度	1.97 - 2.3 Å
構造データ	PDB-4yw1: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, complex with Neu5Ac and Neu5Ac2en following soaking with 3'SL 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.25 Å PDB-4yw2: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, complex 6'SL 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2 Å PDB-4yw3: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, complex with Neu5Ac and Neu5Ac2en following soaking with Neu5Ac2en 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å PDB-4yw5: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, complex with oseltamivir carboxylate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.3 Å PDB-4yz1: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, apo structure. 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.97 Å PDB-4yz2: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, in complex with 2-deoxy-2,3-didehydro-N-acetylneuraminic acid. 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.06 Å PDB-4yz4: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, in complex with N-Acetylneuraminic acid. 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.15 Å PDB-4yz5: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, in complex with 3-Sialyllactose 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.27 Å PDB-5f9t: Crystal Structure of Streptococcus pneumoniae NanC, covalent complex with a fluorinated Neu5Ac derivative 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å
化合物	ChemComp-SIA: N-acetyl-alpha-neuraminic acid / N-アセチル-α-ノイラミン酸 ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-PEG: DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル ChemComp-DAN: 2-DEOXY-2,3-DEHYDRO-N-ACETYL-NEURAMINIC ACID / N-アセチル-2,3-ジデヒドロ-2-デオキシ-α-ノイラミン酸 ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-HOH: WATER ChemComp-G39: (3R,4R,5S)-4-(acetylamino)-5-amino-3-(pentan-3-yloxy)cyclohex-1-ene-1-carboxylic acid / オセルタミビルカルボキシラ-ト / 薬剤, 抗ウイルス剤YM ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン ChemComp-FSI: 5-acetamido-3,5-dideoxy-3-fluoro-D-erythro-alpha-L-manno-non-2-ulopyranosonic acid / (2R,3R,4R,5R,6R)-2,4-ジヒドロキシ-3-フルオロ-5-アセチルアミノ-6-((1R,2R)-1,2(以下略) ChemComp-SFJ*: (2R,3R,4R,5R,6R)-5-acetamido-2,3-difluoro-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic / 2,3α-ジフルオロ-N-アセチル-2-デオキシ-α-ノイラミン酸
由来	streptococcus pneumoniae serotype 4 (strain atcc baa-334 / tigr4) (肺炎レンサ球菌) streptococcus pneumoniae serotype 4 (肺炎レンサ球菌) streptococcus pneumoniae (肺炎レンサ球菌)
キーワード	HYDROLASE / Sialidase / CBM40 / Neuraminidase / 6'SL / Beta-propeller / oseltamivir / TRANSFERASE / propeller / covalent intermediate