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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	GE23077 binds to the RNA polymerase 'i' and 'i+1' sites and prevents the binding of initiating nucleotides.
ジャーナル・号・ページ	Elife, Vol. 3, Page e02450-e02450, Year 2014
掲載日	2013年9月16日 (構造データの登録日)
著者	Zhang, Y. / Degen, D. / Ho, M.X. / Sineva, E. / Ebright, K.Y. / Ebright, Y.W. / Mekler, V. / Vahedian-Movahed, H. / Feng, Y. / Yin, R. ...Zhang, Y. / Degen, D. / Ho, M.X. / Sineva, E. / Ebright, K.Y. / Ebright, Y.W. / Mekler, V. / Vahedian-Movahed, H. / Feng, Y. / Yin, R. / Tuske, S. / Irschik, H. / Jansen, R. / Maffioli, S. / Donadio, S. / Arnold, E. / Ebright, R.H.
リンク	PubMed:24755292
手法	X線回折
解像度	2.8 - 3.624 Å
構造データ	PDB-4mq9: Crystal structure of Thermus thermophilus RNA polymerase holoenzyme in complex with GE23077 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.35 Å PDB-4oin: Crystal structure of Thermus thermophilus transcription initiation complex soaked with GE23077 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.8 Å PDB-4oio: Crystal structure of Thermus thermophilus pre-insertion substrate complex for de novo transcription initiation 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.1 Å PDB-4oip: Crystal structure of Thermus thermophilus transcription initiation complex soaked with GE23077, ATP, and CMPcPP 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.4 Å PDB-4oiq: Crystal structure of Thermus thermophilus transcription initiation complex soaked with GE23077 and rifampicin 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.624 Å PDB-4oir: Crystal structure of Thermus thermophilus RNA polymerase transcription initiation complex soaked with GE23077 and rifamycin SV 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.105 Å
化合物	ChemComp-ZN: Unknown entry ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-MB8: (2Z)-2-methylbut-2-enoic acid / アンゲリカ酸 ChemComp-HOH: WATER ChemComp-ATP: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子YM ChemComp-2TM: 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine / 5′-シチジルオキシホスホニルメチルホスホニルオキシホスホン酸 ChemComp-RFV*: rifamycin SV
由来	thermus thermophilus (バクテリア) actinomadura sp. (バクテリア)
キーワード	TRANSCRIPTION / TRANSFERASE/ANTIBIOTIC / DNA-directed RNA polymerase / transferase-antibiotic complex / GE23077 / transcription inhibitor / transcription open complex / transcription initiation complex / i site / i+1 site / RNA polymerase / DNA/RNA/NTP binding / polymerization of ribonucleotides / nucleoid / TRANSFERASE / de novo transcription initiation / substrate complex / transcription initiation / CMPcPP / rifampicin / Rif / Rifampin / rifamycin SV