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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Contribution of Partial Charge Interactions and Base Stacking to the Efficiency of Primer Extension at and beyond Abasic Sites in DNA.
ジャーナル・号・ページ	Biochemistry, Vol. 51, Page 4922-4931, Year 2012
掲載日	2012年2月21日 (構造データの登録日)
著者	Xia, S. / Vashishtha, A. / Bulkley, D. / Eom, S.H. / Wang, J. / Konigsberg, W.H.
リンク	Biochemistry / PubMed:22630605
手法	X線回折
解像度	1.84 - 2.05 Å
構造データ	PDB-4dtj: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dTTP Opposite an Abasic Site and ddT/dA as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å PDB-4dtm: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dCTP Opposite an Abasic Site and ddG/dC as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.95 Å PDB-4dtn: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dATP Opposite an Abasic Site and ddA/dT as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.96 Å PDB-4dto: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dCTP Opposite an Abasic Site and ddA/dT as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å PDB-4dtp: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dGTP Opposite an Abasic Site and ddA/dT as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å PDB-4dtr: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dATP Opposite an Abasic Site and ddC/dG as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.04 Å PDB-4dts: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dCTP Opposite an Abasic Site and ddC/dG as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.96 Å PDB-4dtu: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dGTP Opposite an Abasic Site and ddC/dG as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.86 Å PDB-4dtx: RB69 DNA Polymerase Ternary Complex with dTTP Opposite an Abasic Site and ddC/dG as the Penultimate Base-pair 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.84 Å
化合物	ChemComp-TTP: THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE / dTTP / チミジン三リン酸 ChemComp-CA: Unknown entry / カルシウムジカチオン ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-DCP: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE / dCTP / デオキシシチジン三リン酸 ChemComp-DTP: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE / dATP / デオキシアデノシン三リン酸 ChemComp-DGT: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / dGTP / デオキシグアノシン三リン酸
由来	enterobacteria phage rb69 (ファージ)
キーワード	Transferase/DNA / abasic site / THF / RB69pol / dTTP (チミジン三リン酸) / Transferase-DNA complex / dCTP (デオキシシチジン三リン酸) / dATP (デオキシアデノシン三リン酸) / dGTP (デオキシグアノシン三リン酸)