EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Crystal Structures of phosphoketolase: thiamine diphosphate-dependent dehydration mechanism
ジャーナル・号・ページ	J. Biol. Chem., Vol. 285, Page 34279-34287, Year 2010
掲載日	2010年4月22日 (構造データの登録日)
著者	Suzuki, R. / Katayama, T. / Kim, B.-J. / Wakagi, T. / Shoun, H. / Ashida, H. / Yamamoto, K. / Fushinobu, S.
リンク	J. Biol. Chem. / PubMed:20739284
手法	X線回折
解像度	1.7 - 2.3 Å
構造データ	PDB-3ahc: Resting form of Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.7 Å PDB-3ahd: Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve complexed with 2-acetyl-thiamine diphosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å PDB-3ahe: Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve complexed with dihydroxyethyl thiamine diphosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.1 Å PDB-3ahf: Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve complexed with inorganic phosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.3 Å PDB-3ahg: H64A mutant of Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve complexed with a tricyclic ring form of thiamine diphosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å PDB-3ahh: H142A mutant of Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve complexed with acetyl thiamine diphosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.1 Å PDB-3ahi: H320A mutant of Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve complexed with acetyl thiamine diphosphate 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.1 Å PDB-3ahj: H553A mutant of Phosphoketolase from Bifidobacterium Breve 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.1 Å
化合物	ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-TPP: THIAMINE DIPHOSPHATE / 3-[(4-アミノ-2-メチル-5-ピリミジニル)メチル]-4-メチル-5-[2-(ホスホノオキシホスフィナトオキシ)(以下略) ChemComp-NA: Unknown entry / ナトリウムカチオン ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-2PE: NONAETHYLENE GLYCOL / 3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコサン-1,26-ジオ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-HOH: WATER ChemComp-HTL: 2-ACETYL-THIAMINE DIPHOSPHATE / AcThDP ChemComp-THD: 2-[3-[(4-AMINO-2-METHYL-5-PYRIMIDINYL)METHYL]-2-(1,2-DIHYDROXYETHYL)-4-METHYL-1,3-THIAZOL-3-IUM-5-YL]ETHYL TRIHYDROGEN ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-HTD: 2-[(9aR)-2,7-dimethyl-9a,10-dihydro-5H-pyrimido[4,5-d][1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidin-8-yl]ethyl trihydrogen diphosphate ChemComp-PG4: TETRAETHYLENE GLYCOL / テトラエチレングリコ-ル / 沈殿剤YM
由来	bifidobacterium breve (バクテリア)
キーワード	LYASE / THIAMINE DIPHOSPHATE-DEPENDENT ENZYME / ALPHA-BETA FOLD / HOMODIMER / LIGAND-FREE STRUCTURE / ACETYL THIAMINE DIPHOSPHATE / DIHYDROXYETHYL THIAMINE DIPHOSPHATE / INORGANIC PHOSPHATE / DIHYDROTHIACHROMINE FORM OF THIAMINE DIPHOSPHATE