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タイトルAn Unbiased Screen for Human Cytomegalovirus Identifies Neuropilin-2 as a Central Viral Receptor.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 174, Issue 5, Page 1158-1171.e19, Year 2018
掲載日2018年8月23日
著者Nadia Martinez-Martin / Jessica Marcandalli / Christine S Huang / Christopher P Arthur / Michela Perotti / Mathilde Foglierini / Hoangdung Ho / Annie M Dosey / Stephanie Shriver / Jian Payandeh / Alexander Leitner / Antonio Lanzavecchia / Laurent Perez / Claudio Ciferri /
PubMed 要旨Characterizing cell surface receptors mediating viral infection is critical for understanding viral tropism and developing antiviral therapies. Nevertheless, due to challenges associated with ...Characterizing cell surface receptors mediating viral infection is critical for understanding viral tropism and developing antiviral therapies. Nevertheless, due to challenges associated with detecting protein interactions on the cell surface, the host receptors of many human pathogens remain unknown. Here, we build a library consisting of most single transmembrane human receptors and implement a workflow for unbiased and high-sensitivity detection of receptor-ligand interactions. We apply this technology to elucidate the long-sought receptor of human cytomegalovirus (HCMV), the leading viral cause of congenital birth defects. We identify neuropilin-2 (Nrp2) as the receptor for HCMV-pentamer infection in epithelial/endothelial cells and uncover additional HCMV interactors. Using a combination of biochemistry, cell-based assays, and electron microscopy, we characterize the pentamer-Nrp2 interaction and determine the architecture of the pentamer-Nrp2 complex. This work represents an important approach to the study of host-pathogen interactions and provides a framework for understanding HCMV infection, neutralization, and the development of novel anti-HCMV therapies.
リンクCell / PubMed:30057110
手法EM (単粒子)
解像度25.0 Å
構造データ

EMDB-8884:
RCT reconstruction of HCMV Pentamer with receptor and 3G16 Fab fragment.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

由来
  • Human cytomegalovirus (ヘルペスウイルス)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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