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Structure paper

タイトルStructural insights into the activation and inhibition of the ADAM17-iRhom2 complex.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 122, Issue 24, Page e2500732122, Year 2025
掲載日2025年6月17日
著者Joseph J Maciag / Conner E Slone / Hala F Alnajjar / Maria F Rich / Bryce Guion / Igal Ifergan / Carl P Blobel / Tom C M Seegar /
PubMed 要旨The endopeptidase activity of ADAM (a disintegrin and metalloproteinase)-17, the primary processor of several EGFR ligands and tumor necrosis factor-alpha (TNF-α), is essential for proper embryonic ...The endopeptidase activity of ADAM (a disintegrin and metalloproteinase)-17, the primary processor of several EGFR ligands and tumor necrosis factor-alpha (TNF-α), is essential for proper embryonic development and immune regulation. Dysregulated ADAM17 activity is prevalent in a wide array of human diseases, including cancer, chronic inflammation, and SARS-CoV-2 viral progression. Initially translated as an inactive zymogen, ADAM17 maturation and enzymatic function are tightly regulated by its obligate binding partners, the inactive rhomboid proteins (iRhom) -1 and -2. Here, we present the cryo-EM structure of the ADAM17 zymogen bound to iRhom2. Our findings elucidate the interactions within the ADAM17-iRhom2 complex, the inhibitory mechanisms of the therapeutic MEDI3622 antibody and ADAM17 prodomain, and the previously unknown role of a membrane-proximal cytoplasmic reentry loop of iRhom2 involved in the mechanism of activation. Importantly, we perform cellular assays to validate our structural findings and provide further insights into the functional implications of these interactions, paving the way for developing therapeutic strategies targeting this biomedically critical enzyme complex.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:40512800 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.5 - 3.53 Å
構造データ

70123

9o54

EMDB-70123, PDB-9o54:
ADAM17 Prodomain-Metalloproteinase Domains bound to MEDI3622 Fab
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

70127

9o58

EMDB-70127, PDB-9o58:
Zymogen ADAM17-iRhom2 complex bound by the MEDI3622 Fab
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.53 Å

化合物

ChemComp-ZN:
Unknown entry

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

ChemComp-CA:
Unknown entry

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • aequorea victoria (オワンクラゲ)
キーワードIMMUNE SYSTEM / Inhibitor / Complex / Sheddase

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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