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タイトルThe Erlin1/2 complex is a dynamic scaffold for membrane microdomain assembly on the endoplasmic reticulum.
ジャーナル・号・ページMol Cell, Vol. 86, Issue 7, Page 1362-11376.e5, Year 2026
掲載日2026年4月2日
著者Lu Yan / Zihong Xu / Yuanhang Yao / Tadsanee Awang / Xiaoting Wang / Yonglun Wang / Chengying Ma / Ningning Li / Chen Song / Xiao-Wei Chen / Ning Gao /
PubMed 要旨The SPFH (stomatin, prohibitin, flotillin, and HflK/C) family proteins are proposed scaffolds for organizing functional membrane microdomains (FMMs) on various cellular membranes. Erlin1 and Erlin2, ...The SPFH (stomatin, prohibitin, flotillin, and HflK/C) family proteins are proposed scaffolds for organizing functional membrane microdomains (FMMs) on various cellular membranes. Erlin1 and Erlin2, two endoplasmic reticulum (ER)-residing SPFH members, as heteromeric complexes, participate in ER-associated protein degradation (ERAD). However, the mechanisms underlying Erlin-mediated FMM organization and ERAD regulation remain poorly understood. Here, through cryoelectron microscopy (cryo-EM), we find that the human Erlin1/2 complex forms a 26-mer cage assembly, defining a nanometer-sized microdomain on the luminal leaflet. The intramembrane region of each subunit constitutes a specific phosphatidylinositol-binding pocket. ER proteins can be recruited to both the interior and exterior of these cages. By caging cargoes, the Erlin1/2 complex physically secludes them from their substrates or binding partners, conferring another layer of regulation on their functions. Moreover, individual cages can cluster to organize FMMs of different sizes. These dynamic properties underscore a general regulatory role of Erlin1/2 in various ER-related biological processes, including coronaviral replication.
リンクMol Cell / PubMed:41887216
手法EM (単粒子)
解像度2.6 - 2.8 Å
構造データ

65379

9vvg

EMDB-65379, PDB-9vvg:
Cryo-EM structure of the erlin1/2 complex purified using GDN and CHS
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.7 Å

65382

9vvj

EMDB-65382, PDB-9vvj:
Cryo-EM structure of the erlin1/2 complex purified using DDM and GDN
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-65430: Cryo-EM structure of the cage-top domain of the erlin1/2 complex purified using DDM and GDN
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.7 Å

EMDB-65432: Cryo-EM overall structure of the erlin1/2 complex purified using DDM and GDN
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-65436: Cryo-EM overall structure of the erlin1/2 complex purified using GDN and CHS
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.7 Å

EMDB-65438: Cryo-EM structure of the cage-top domain of the erlin1/2 complex purified using GDN and CHS
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / Cryo-EM / complex / SPFH protein family

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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