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Structure paper

タイトルIdentification and engineering of potent bispecific antibodies that protect against herpes simplex virus recurrent disease.
ジャーナル・号・ページCell Rep, Vol. 44, Issue 8, Page 116063, Year 2025
掲載日2025年7月26日
著者Chingwei V Lee / Hector Viadiu / Apurva Kalamkar / David I Bernstein / Andrew Pae / Xinchao Yu / Sylvia Wong / Fernando J Bravo / Sheng Ding / Elbert Seto / Magdeleine Hung / Yu Yu / Weimei Xing / Giuseppe A Papalia / Wei Kan / Brian Carr / Majlinda Thomas / Leah Tong / Priyanka Desai / Nadine Jarrousse / Alexandre Mercier / Meghan M Holdorf / Simon P Fletcher / Emma Abernathy /
PubMed 要旨Herpes simplex virus (HSV) causes lifelong infections, including oral and genital herpes. There is no vaccine, and current antivirals are only partially effective at reducing symptoms and ...Herpes simplex virus (HSV) causes lifelong infections, including oral and genital herpes. There is no vaccine, and current antivirals are only partially effective at reducing symptoms and transmission. Therapeutic antibodies offer a potentially long-acting treatment option, although efforts to pursue this have been limited. We performed an alpaca immunization campaign and discovered high-affinity antibodies that both neutralized and completely blocked cell-to-cell spread (CCS), a key mechanism by which HSV evades neutralizing antibodies. Unexpectedly, we found that engineering antibodies into a bispecific format targeting two viral glycoproteins dramatically increased antiviral potency. Solving the structures of three antibodies using cryo-electron microscopy (cryo-EM) revealed a mechanistic understanding of how the bispecific format could enhance potency. Lastly, these bispecific antibodies significantly reduced lesion development in the guinea pig model of genital herpes, demonstrating that delayed dosing after latency establishment can reduce disease and confirming their potential as a transformative treatment option.
リンクCell Rep / PubMed:40716063
手法EM (単粒子)
解像度2.1 - 2.3 Å
構造データ

48671

9mvu

EMDB-48671, PDB-9mvu:
C6 Herpes Virus Simplex Neutralizing Nanobody Bound to HSV Glycoprotein gB
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.2 Å

48677

9mw5

EMDB-48677, PDB-9mw5:
D1 Herpes Virus Simplex Neutralizing Nanobody Bound to HSV Glycoprotein gB
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.1 Å

48730

9my8

EMDB-48730, PDB-9my8:
D7 Herpes Virus Simplex Neutralizing Nanobody Bound to HSV Glycoprotein gD
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.3 Å

化合物

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-NA:
Unknown entry

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • human herpesvirus 1 (strain 17) (ヘルペスウイルス)
  • lama glama (ラマ)
  • human herpesvirus 2 (ヘルペスウイルス)
キーワードANTIVIRAL PROTEIN / Neutralizing Antibody

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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