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タイトルMolecular insights into atypical modes of β-arrestin interaction with seven transmembrane receptors.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 383, Issue 6678, Page 101-108, Year 2024
掲載日2024年1月5日
著者Jagannath Maharana / Fumiya K Sano / Parishmita Sarma / Manish K Yadav / Longhan Duan / Tomasz M Stepniewski / Madhu Chaturvedi / Ashutosh Ranjan / Vinay Singh / Sayantan Saha / Gargi Mahajan / Mohamed Chami / Wataru Shihoya / Jana Selent / Ka Young Chung / Ramanuj Banerjee / Osamu Nureki / Arun K Shukla /
PubMed 要旨β-arrestins (βarrs) are multifunctional proteins involved in signaling and regulation of seven transmembrane receptors (7TMRs), and their interaction is driven primarily by agonist-induced receptor ...β-arrestins (βarrs) are multifunctional proteins involved in signaling and regulation of seven transmembrane receptors (7TMRs), and their interaction is driven primarily by agonist-induced receptor activation and phosphorylation. Here, we present seven cryo-electron microscopy structures of βarrs either in the basal state, activated by the muscarinic receptor subtype 2 (M2R) through its third intracellular loop, or activated by the βarr-biased decoy D6 receptor (D6R). Combined with biochemical, cellular, and biophysical experiments, these structural snapshots allow the visualization of atypical engagement of βarrs with 7TMRs and also reveal a structural transition in the carboxyl terminus of βarr2 from a β strand to an α helix upon activation by D6R. Our study provides previously unanticipated molecular insights into the structural and functional diversity encoded in 7TMR-βarr complexes with direct implications for exploring novel therapeutic avenues.
リンクScience / PubMed:38175886 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.9 - 6.53 Å
構造データ

34174

8go9

EMDB-34174, PDB-8go9:
Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Atypical chemokine receptor 2, ACKR2 (D6R)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.35 Å

36078

8j8r

EMDB-36078, PDB-8j8r:
Structure of beta-arrestin2 in complex with M2Rpp
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

36081

8j8v

EMDB-36081, PDB-8j8v:
Structure of beta-arrestin2 in complex with D6Rpp (Local Refine)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.22 Å

36082

8j8z

EMDB-36082, PDB-8j8z:
Structure of beta-arrestin1 in complex with D6Rpp
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

36090

8j97

EMDB-36090, PDB-8j97:
Structure of Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 (Local refine, cross-linked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-36091: Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 (Low resolution full map, Cross-linked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.53 Å

EMDB-36093: Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 (Low resolution full map, non-crosslinked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.4 Å

36110

8j9k

EMDB-36110, PDB-8j9k:
Structure of basal beta-arrestin2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

36124

8ja3

EMDB-36124, PDB-8ja3:
Structure of beta-arrestin1 in complex with C3aRpp
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.94 Å

36126

8jaf

EMDB-36126, PDB-8jaf:
Structure of Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 (Local Refine, non-cross linked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

由来
  • bos taurus (ウシ)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • homo sapiens (ヒト)
  • rattus norvegicus (ドブネズミ)
キーワードSIGNALING PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / GPCR / Arrestin / SIGNALING PROTEIN / SIGNALING PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / SYGNALING PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / SYGNALING PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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