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タイトルNon-overlapping epitopes on the gHgL-gp42 complex for the rational design of a triple-antibody cocktail against EBV infection.
ジャーナル・号・ページCell Rep Med, Vol. 4, Issue 11, Page 101296, Year 2023
掲載日2023年11月21日
著者Junping Hong / Ling Zhong / Liqin Liu / Qian Wu / Wanlin Zhang / Kaiyun Chen / Dongmei Wei / Hui Sun / Xiang Zhou / Xinyu Zhang / Yin-Feng Kang / Yang Huang / Junyu Chen / Guosong Wang / Yan Zhou / Yanhong Chen / Qi-Sheng Feng / Hai Yu / Shaowei Li / Mu-Sheng Zeng / Yi-Xin Zeng / Miao Xu / Qingbing Zheng / Yixin Chen / Xiao Zhang / Ningshao Xia /
PubMed 要旨Epstein-Barr virus (EBV) is closely associated with cancer, multiple sclerosis, and post-acute coronavirus disease 2019 (COVID-19) sequelae. There are currently no approved therapeutics or vaccines ...Epstein-Barr virus (EBV) is closely associated with cancer, multiple sclerosis, and post-acute coronavirus disease 2019 (COVID-19) sequelae. There are currently no approved therapeutics or vaccines against EBV. It is noteworthy that combining multiple EBV glycoproteins can elicit potent neutralizing antibodies (nAbs) against viral infection, suggesting possible synergistic effects. Here, we characterize three nAbs (anti-gp42 5E3, anti-gHgL 6H2, and anti-gHgL 10E4) targeting different glycoproteins of the gHgL-gp42 complex. Two antibody cocktails synergistically neutralize infection in B cells (5E3+6H2+10E4) and epithelial cells (6H2+10E4) in vitro. Moreover, 5E3 alone and the 5E3+6H2+10E4 cocktail confer potent in vivo protection against lethal EBV challenge in humanized mice. The cryo-EM structure of a heptatomic gHgL-gp42 immune complex reveals non-overlapping epitopes of 5E3, 6H2, and 10E4 on the gHgL-gp42 complex. Structural and functional analyses highlight different neutralization mechanisms for each of the three nAbs. In summary, our results provide insight for the rational design of therapeutics or vaccines against EBV infection.
リンクCell Rep Med / PubMed:37992686 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.52 - 3.64 Å
構造データ

33990

7yoy

EMDB-33990, PDB-7yoy:
Cryo-EM structure of EBV gHgL-gp42 in complex with mAbs 3E8 and 5E3 (localized refinement)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.64 Å

33992

7yp1

EMDB-33992, PDB-7yp1:
Cryo-EM structure of EBV gHgL-gp42 in complex with mAb 10E4 (localized refinement)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.54 Å

EMDB-33993: Cryo-EM density map of EBV gHgL-gp42 in complex with four mAbs 5E3, 3E8, 6H2 and 10E4
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.59 Å

33994

7yp2

EMDB-33994, PDB-7yp2:
Cryo-EM structure of EBV gHgL-gp42 in complex with mAb 6H2 (localized refinement)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.52 Å

由来
  • human gammaherpesvirus 4 (ヘルペスウイルス)
  • oryctolagus cuniculus (ウサギ)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードVIRAL PROTEIN / EBV / Cryo-EM / Glycoprotein / gHgL-gp42 complex / Antibody

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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