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タイトルExtremely potent human monoclonal antibodies from COVID-19 convalescent patients.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 184, Issue 7, Page 1821-1835.e16, Year 2021
掲載日2021年4月1日
著者Emanuele Andreano / Emanuele Nicastri / Ida Paciello / Piero Pileri / Noemi Manganaro / Giulia Piccini / Alessandro Manenti / Elisa Pantano / Anna Kabanova / Marco Troisi / Fabiola Vacca / Dario Cardamone / Concetta De Santi / Jonathan L Torres / Gabriel Ozorowski / Linda Benincasa / Hyesun Jang / Cecilia Di Genova / Lorenzo Depau / Jlenia Brunetti / Chiara Agrati / Maria Rosaria Capobianchi / Concetta Castilletti / Arianna Emiliozzi / Massimiliano Fabbiani / Francesca Montagnani / Luisa Bracci / Giuseppe Sautto / Ted M Ross / Emanuele Montomoli / Nigel Temperton / Andrew B Ward / Claudia Sala / Giuseppe Ippolito / Rino Rappuoli /
PubMed 要旨Human monoclonal antibodies are safe, preventive, and therapeutic tools that can be rapidly developed to help restore the massive health and economic disruption caused by the coronavirus disease 2019 ...Human monoclonal antibodies are safe, preventive, and therapeutic tools that can be rapidly developed to help restore the massive health and economic disruption caused by the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. By single-cell sorting 4,277 SARS-CoV-2 spike protein-specific memory B cells from 14 COVID-19 survivors, 453 neutralizing antibodies were identified. The most potent neutralizing antibodies recognized the spike protein receptor-binding domain, followed in potency by antibodies that recognize the S1 domain, the spike protein trimer, and the S2 subunit. Only 1.4% of them neutralized the authentic virus with a potency of 1-10 ng/mL. The most potent monoclonal antibody, engineered to reduce the risk of antibody-dependent enhancement and prolong half-life, neutralized the authentic wild-type virus and emerging variants containing D614G, E484K, and N501Y substitutions. Prophylactic and therapeutic efficacy in the hamster model was observed at 0.25 and 4 mg/kg respectively in absence of Fc functions.
リンクCell / PubMed:33667349 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度26.0 - 29.0 Å
構造データ

EMDB-23523:
SARS-2 CoV 6P Mut7 in complex with Fab J08
手法: EM (単粒子) / 解像度: 29.0 Å

EMDB-23524:
SARS-2 CoV 6P Mut7 in complex with Fab F05
手法: EM (単粒子) / 解像度: 26.0 Å

EMDB-23525:
SARS-2 CoV 6P Mut 7 in complex with fragment antigen binding (fab) I14
手法: EM (単粒子) / 解像度: 29.0 Å

由来
  • Homo sapiens (ヒト)
  • Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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