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タイトルStructure and Dynamics of Adrenomedullin Receptors AM and AM Reveal Key Mechanisms in the Control of Receptor Phenotype by Receptor Activity-Modifying Proteins.
ジャーナル・号・ページACS Pharmacol Transl Sci, Vol. 3, Issue 2, Page 263-284, Year 2020
掲載日2020年4月10日
著者Yi-Lynn Liang / Matthew J Belousoff / Madeleine M Fletcher / Xin Zhang / Maryam Khoshouei / Giuseppe Deganutti / Cassandra Koole / Sebastian G B Furness / Laurence J Miller / Debbie L Hay / Arthur Christopoulos / Christopher A Reynolds / Radostin Danev / Denise Wootten / Patrick M Sexton /
PubMed 要旨Adrenomedullin (AM) and calcitonin gene-related peptide (CGRP) receptors are critically important for metabolism, vascular tone, and inflammatory response. AM receptors are also required for normal ...Adrenomedullin (AM) and calcitonin gene-related peptide (CGRP) receptors are critically important for metabolism, vascular tone, and inflammatory response. AM receptors are also required for normal lymphatic and blood vascular development and angiogenesis. They play a pivotal role in embryo implantation and fertility and can provide protection against hypoxic and oxidative stress. CGRP and AM receptors are heterodimers of the calcitonin receptor-like receptor (CLR) and receptor activity-modifying protein 1 (RAMP1) (CGRPR), as well as RAMP2 or RAMP3 (AMR and AMR, respectively). However, the mechanistic basis for RAMP modulation of CLR phenotype is unclear. In this study, we report the cryo-EM structure of the AMR in complex with AM and Gs at a global resolution of 3.0 Å, and structures of the AMR in complex with either AM or intermedin/adrenomedullin 2 (AM2) and Gs at 2.4 and 2.3 Å, respectively. The structures reveal distinctions in the primary orientation of the extracellular domains (ECDs) relative to the receptor core and distinct positioning of extracellular loop 3 (ECL3) that are receptor-dependent. Analysis of dynamic data present in the cryo-EM micrographs revealed additional distinctions in the extent of mobility of the ECDs. Chimeric exchange of the linker region of the RAMPs connecting the TM helix and the ECD supports a role for this segment in controlling receptor phenotype. Moreover, a subset of the motions of the ECD appeared coordinated with motions of the G protein relative to the receptor core, suggesting that receptor ECD dynamics could influence G protein interactions. This work provides fundamental advances in our understanding of GPCR function and how this can be allosterically modulated by accessory proteins.
リンクACS Pharmacol Transl Sci / PubMed:32296767 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.3 - 3.0 Å
構造データ

20883

6uun

EMDB-20883, PDB-6uun:
CryoEM Structure of the active Adrenomedullin 1 receptor G protein complex with adrenomedullin peptide
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

20901

6uus

EMDB-20901, PDB-6uus:
CryoEM Structure of the active Adrenomedullin 2 receptor G protein complex with adrenomedullin peptide
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.4 Å

20906

6uva

EMDB-20906, PDB-6uva:
CryoEM Structure of the active Adrenomedullin 2 receptor G protein complex with adrenomedullin 2 peptide
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.3 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • lama glama (ラマ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / GPCR / adrenomedullin receptor complex / adrenomedullin 2 receptor complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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