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Structure paper

タイトルThe assembly of the Mitochondrial Complex I Assembly complex uncovers a redox pathway coordination.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 14, Issue 1, Page 8248, Year 2023
掲載日2023年12月12日
著者Lindsay McGregor / Samira Acajjaoui / Ambroise Desfosses / Melissa Saïdi / Maria Bacia-Verloop / Jennifer J Schwarz / Pauline Juyoux / Jill von Velsen / Matthew W Bowler / Andrew A McCarthy / Eaazhisai Kandiah / Irina Gutsche / Montserrat Soler-Lopez /
PubMed 要旨The Mitochondrial Complex I Assembly (MCIA) complex is essential for the biogenesis of respiratory Complex I (CI), the first enzyme in the respiratory chain, which has been linked to Alzheimer's ...The Mitochondrial Complex I Assembly (MCIA) complex is essential for the biogenesis of respiratory Complex I (CI), the first enzyme in the respiratory chain, which has been linked to Alzheimer's disease (AD) pathogenesis. However, how MCIA facilitates CI assembly, and how it is linked with AD pathogenesis, is poorly understood. Here we report the structural basis of the complex formation between the MCIA subunits ECSIT and ACAD9. ECSIT binding induces a major conformational change in the FAD-binding loop of ACAD9, releasing the FAD cofactor and converting ACAD9 from a fatty acid β-oxidation (FAO) enzyme to a CI assembly factor. We provide evidence that ECSIT phosphorylation downregulates its association with ACAD9 and is reduced in neuronal cells upon exposure to amyloid-β (Aβ) oligomers. These findings advance our understanding of the MCIA complex assembly and suggest a possible role for ECSIT in the reprogramming of bioenergetic pathways linked to Aβ toxicity, a hallmark of AD.
リンクNat Commun / PubMed:38086790 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.1 - 6.0 Å
構造データ

17659

8phe

EMDB-17659, PDB-8phe:
ACAD9-WT in complex with ECSIT-CTER
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

17660

8phf

EMDB-17660, PDB-8phf:
Cryo-EM structure of human ACAD9-S191A
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-17661: ACAD9 homodimer WT
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.0 Å

化合物

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-FAD:
FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE / FAD / FAD*YM

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードSIGNALING PROTEIN / Oxidative phosphorylation (OXPHOS) / Fatty Acid Oxidation (FAO) / Mitochondrial Complex I Assembly Complex (MCIA) / Amyloid-beta / ECSIT phosphorylation / FLAVOPROTEIN

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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