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タイトルL-form conversion in Gram-positive bacteria enables escape from phage infection.
ジャーナル・号・ページNat Microbiol, Vol. 8, Issue 3, Page 387-399, Year 2023
掲載日2023年1月30日
著者Jan C Wohlfarth / Miki Feldmüller / Alissa Schneller / Samuel Kilcher / Marco Burkolter / Susanne Meile / Martin Pilhofer / Markus Schuppler / Martin J Loessner /
PubMed 要旨At the end of a lytic bacteriophage replication cycle in Gram-positive bacteria, peptidoglycan-degrading endolysins that cause explosive cell lysis of the host can also attack non-infected bystander ...At the end of a lytic bacteriophage replication cycle in Gram-positive bacteria, peptidoglycan-degrading endolysins that cause explosive cell lysis of the host can also attack non-infected bystander cells. Here we show that in osmotically stabilized environments, Listeria monocytogenes can evade phage predation by transient conversion to a cell wall-deficient L-form state. This L-form escape is triggered by endolysins disintegrating the cell wall from without, leading to turgor-driven extrusion of wall-deficient, yet viable L-form cells. Remarkably, in the absence of phage predation, we show that L-forms can quickly revert to the walled state. These findings suggest that L-form conversion represents a population-level persistence mechanism to evade complete eradication by phage attack. Importantly, we also demonstrate phage-mediated L-form switching of the urinary tract pathogen Enterococcus faecalis in human urine, which underscores that this escape route may be widespread and has important implications for phage- and endolysin-based therapeutic interventions.
リンクNat Microbiol / PubMed:36717719 / PubMed Central
手法EM (トモグラフィー)
構造データ

EMDB-16284: Cryotomogram of L-form-like cytoplasmic membrane vesicles of Listeria monocytogenes Rev2 cell
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16285: Cryotomogram of endolysin Ply006 treated Listeria monocytogenes Rev2 cell (stage 1)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16286: Cryotomogram of endolysin Ply006 treated Listeria monocytogenes Rev2 cell (stage 2)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16287: Cryotomogram of a A006 virion attaching to a Listeria monocytogenes Rev2 cell
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16288: Cryotomogram of endolysin Ply006 treated Listeria monocytogenes Rev2 cell (stage 3)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16289: Cryotomogram of endolysin Ply007 treated Enterococcus faecalis cells
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16290: Cryotomogram of endolysin Ply007 treated Enterococcus faecalis cells
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16291: Cryotomogram of individual Efs7 virions and phage attachment to a Enterococcus faecalis cell
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16305: Cryotomogram of endolysin Ply007 treated Enterococcus faecalis cells
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16306: Cryotomogram of Listeria monocytogenes Rev2 cells
手法: EM (トモグラフィー)

由来
  • Listeria monocytogenes (バクテリア)
  • Enterococcus faecalis (乳酸球菌)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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