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Structure paper

タイトルCSPP1 stabilizes growing microtubule ends and damaged lattices from the luminal side.
ジャーナル・号・ページJ Cell Biol, Vol. 222, Issue 4, Year 2023
掲載日2023年4月3日
著者Cyntha M van den Berg / Vladimir A Volkov / Sebastian Schnorrenberg / Ziqiang Huang / Kelly E Stecker / Ilya Grigoriev / Sania Gilani / Kari-Anne M Frikstad / Sebastian Patzke / Timo Zimmermann / Marileen Dogterom / Anna Akhmanova /
PubMed 要旨Microtubules are dynamic cytoskeletal polymers, and their organization and stability are tightly regulated by numerous cellular factors. While regulatory proteins controlling the formation of ...Microtubules are dynamic cytoskeletal polymers, and their organization and stability are tightly regulated by numerous cellular factors. While regulatory proteins controlling the formation of interphase microtubule arrays and mitotic spindles have been extensively studied, the biochemical mechanisms responsible for generating stable microtubule cores of centrioles and cilia are poorly understood. Here, we used in vitro reconstitution assays to investigate microtubule-stabilizing properties of CSPP1, a centrosome and cilia-associated protein mutated in the neurodevelopmental ciliopathy Joubert syndrome. We found that CSPP1 preferentially binds to polymerizing microtubule ends that grow slowly or undergo growth perturbations and, in this way, resembles microtubule-stabilizing compounds such as taxanes. Fluorescence microscopy and cryo-electron tomography showed that CSPP1 is deposited in the microtubule lumen and inhibits microtubule growth and shortening through two separate domains. CSPP1 also specifically recognizes and stabilizes damaged microtubule lattices. These data help to explain how CSPP1 regulates the elongation and stability of ciliary axonemes and other microtubule-based structures.
リンクJ Cell Biol / PubMed:36752787 / PubMed Central
手法EM (トモグラフィー)
構造データ

EMDB-15236: Microtubules
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15237: Microtubules in presence of CSPP-L
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15238: Microtubules in presence of CSPP-L and vinblastine
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15239: Microtubules in presence of CSPP-L and vinblastine
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15245: Taxol-stabilized microtubules in presence of CSPP-L
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15246: Microtubules in presence of vinblastine
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15247: Microtubules in presence of CSPP-L and vinblastine
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15248: Microtubules in presence of vinblastine
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15249: Microtubules
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15250: Microtubules in presence of CSPP-L and vinblastine
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15251: Microtubules in presence of CSPP-L and vinblastine
手法: EM (トモグラフィー)

由来
  • Sus scrofa (ブタ)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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