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タイトルModular capsid decoration boosts adenovirus vaccine-induced humoral immunity against SARS-CoV-2.
ジャーナル・号・ページMol Ther, Vol. 30, Issue 12, Page 3639-3657, Year 2022
掲載日2022年12月7日
著者Matthew D J Dicks / Louisa M Rose / Rebecca A Russell / Lesley A H Bowman / Carl Graham / Jose M Jimenez-Guardeño / Katie J Doores / Michael H Malim / Simon J Draper / Mark Howarth / Sumi Biswas /
PubMed 要旨Adenovirus vector vaccines have been widely and successfully deployed in response to coronavirus disease 2019 (COVID-19). However, despite inducing potent T cell immunity, improvement of vaccine- ...Adenovirus vector vaccines have been widely and successfully deployed in response to coronavirus disease 2019 (COVID-19). However, despite inducing potent T cell immunity, improvement of vaccine-specific antibody responses upon homologous boosting is modest compared with other technologies. Here, we describe a system enabling modular decoration of adenovirus capsid surfaces with antigens and demonstrate potent induction of humoral immunity against these displayed antigens. Ligand attachment via a covalent bond was achieved using a protein superglue, DogTag/DogCatcher (similar to SpyTag/SpyCatcher), in a rapid and spontaneous reaction requiring only co-incubation of ligand and vector components. DogTag was inserted into surface-exposed loops in the adenovirus hexon protein to allow attachment of DogCatcher-fused ligands on virus particles. Efficient coverage of the capsid surface was achieved using various ligands, with vector infectivity retained in each case. Capsid decoration shielded particles from vector neutralizing antibodies. In prime-boost regimens, adenovirus vectors decorated with the receptor-binding domain of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) spike induced >10-fold higher SARS-CoV-2 neutralization titers compared with an undecorated vector encoding spike. Importantly, decorated vectors achieved equivalent or superior T cell immunogenicity against encoded antigens compared with undecorated vectors. We propose capsid decoration using protein superglues as a novel strategy to improve efficacy and boostability of adenovirus-based vaccines and therapeutics.
リンクMol Ther / PubMed:35949171 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度10.5 Å
構造データ

EMDB-14370: Ad-DogTag:DogCatcher-RBD
手法: EM (単粒子) / 解像度: 10.5 Å

EMDB-14371: Ad-DogTag
手法: EM (単粒子) / 解像度: 10.5 Å

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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