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タイトルA dynein-associated photoreceptor protein prevents ciliary acclimation to blue light.
ジャーナル・号・ページSci Adv, Vol. 7, Issue 9, Year 2021
掲載日2021年2月26日
著者Osamu Kutomi / Ryosuke Yamamoto / Keiko Hirose / Katsutoshi Mizuno / Yuuhei Nakagiri / Hiroshi Imai / Akira Noga / Jagan Mohan Obbineni / Noemi Zimmermann / Masako Nakajima / Daisuke Shibata / Misa Shibata / Kogiku Shiba / Masaki Kita / Hideo Kigoshi / Yui Tanaka / Yuya Yamasaki / Yuma Asahina / Chihong Song / Mami Nomura / Mamoru Nomura / Ayako Nakajima / Mia Nakachi / Lixy Yamada / Shiori Nakazawa / Hitoshi Sawada / Kazuyoshi Murata / Kaoru Mitsuoka / Takashi Ishikawa / Ken-Ichi Wakabayashi / Takahide Kon / Kazuo Inaba /
PubMed 要旨Light-responsive regulation of ciliary motility is known to be conducted through modulation of dyneins, but the mechanism is not fully understood. Here, we report a novel subunit of the two-headed ...Light-responsive regulation of ciliary motility is known to be conducted through modulation of dyneins, but the mechanism is not fully understood. Here, we report a novel subunit of the two-headed f/I1 inner arm dynein, named DYBLUP, in animal spermatozoa and a unicellular green alga. This subunit contains a BLUF (sensors of blue light using FAD) domain that appears to directly modulate dynein activity in response to light. DYBLUP (dynein-associated BLUF protein) mediates the connection between the f/I1 motor domain and the tether complex that links the motor to the doublet microtubule. lacking the DYBLUP ortholog shows both positive and negative phototaxis but becomes acclimated and attracted to high-intensity blue light. These results suggest a mechanism to avoid toxic strong light via direct photoregulation of dyneins.
リンクSci Adv / PubMed:33637535 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均)
解像度25.0 Å
構造データ

EMDB-12160:
Cilia from MOT7 deletion mutant of Chlamydomonas
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-12161:
Chlamydomonas cilia with MOT7-BCCP labeled
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-12162:
Microtubule doublet structure from WT Chlamydomonas as a control for MOT7 mutants
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 25.0 Å

由来
  • Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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