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タイトルComparative studies of the low-resolution structure of two p23 co-chaperones for Hsp90 identified in Plasmodium falciparum genome.
ジャーナル・号・ページInt J Biol Macromol, Vol. 108, Page 193-204, Year 2018
掲載日2017年11月27日
著者Noeli S M Silva / Thiago V Seraphim / Karine Minari / Leandro R S Barbosa / Júlio C Borges /
PubMed 要旨The p23 proteins are small acidic proteins that aid the functional cycle of the Hsp90 molecular chaperone. Such co-chaperone acts by temporarily inhibiting the ATPase activity of Hsp90 and exhibits ...The p23 proteins are small acidic proteins that aid the functional cycle of the Hsp90 molecular chaperone. Such co-chaperone acts by temporarily inhibiting the ATPase activity of Hsp90 and exhibits intrinsic chaperone activity, suggesting independent roles. A search for p23 in the Plasmodium falciparum genome led to the identification of two putative proteins showing 13% identity to each other and approximately 20% identity to human p23. To understand the presence of two p23 proteins in this organism, we generated recombinant p23 proteins (Pfp23A and Pfp23B) and investigated their structure and function. The proteins presented some similarities and dissimilarities in structural contents and showed different chemical and thermal stabilities, with Pfp23A being more stable than Pfp23B, suggesting that these proteins may present different functions in this organism. Both Pfp23 proteins behaved as elongated monomers in solution and were capable of preventing the thermal-induced aggregation of model client proteins with different efficiencies. Finally, the Pfp23 proteins inhibited the ATPase activity of recombinant P. falciparum Hsp90 (PfHsp90). These results validate the studied proteins as p23 proteins and co-chaperones of PfHsp90.
リンクInt J Biol Macromol / PubMed:29191421
手法SAS (X-ray synchrotron)
構造データ

SASDC55:
Plasmodium falciparum p23A (CS domain protein, putative, Pfp23A)
手法: SAXS/SANS

SASDC65:
Plasmodium falciparum p23B (Co-chaperone p23, Pfp23B)
手法: SAXS/SANS

由来
  • Plasmodium falciparum (マラリア病原虫)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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