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Structure paper

タイトルCa-induced movement of tropomyosin on native cardiac thin filaments revealed by cryoelectron microscopy.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 114, Issue 26, Page 6782-6787, Year 2017
掲載日2017年6月27日
著者Cristina Risi / Jamie Eisner / Betty Belknap / David H Heeley / Howard D White / Gunnar F Schröder / Vitold E Galkin /
PubMed 要旨Muscle contraction relies on the interaction of myosin motors with F-actin, which is regulated through a translocation of tropomyosin by the troponin complex in response to Ca The current model of ...Muscle contraction relies on the interaction of myosin motors with F-actin, which is regulated through a translocation of tropomyosin by the troponin complex in response to Ca The current model of muscle regulation holds that at relaxing (low-Ca) conditions tropomyosin blocks myosin binding sites on F-actin, whereas at activating (high-Ca) conditions tropomyosin translocation only partially exposes myosin binding sites on F-actin so that binding of rigor myosin is required to fully activate the thin filament (TF). Here we used a single-particle approach to helical reconstruction of frozen hydrated native cardiac TFs under relaxing and activating conditions to reveal the azimuthal movement of the tropomyosin on the surface of the native cardiac TF upon Ca activation. We demonstrate that at either relaxing or activating conditions tropomyosin is not constrained in one structural state, but rather is distributed between three structural positions on the surface of the TF. We show that two of these tropomyosin positions restrain actomyosin interactions, whereas in the third position, which is significantly enhanced at high Ca, tropomyosin does not block myosin binding sites on F-actin. Our data provide a structural framework for the enhanced activation of the cardiac TF over the skeletal TF by Ca and lead to a mechanistic model for the regulation of the cardiac TF.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:28607071 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度8.0 - 11.0 Å
構造データ

3665

5nog

EMDB-3665, PDB-5nog:
Ca2+-induced Movement of Tropomyosin on Native Cardiac Thin Filaments - "Blocked" state
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 11.0 Å

3666

5noj

EMDB-3666, PDB-5noj:
Ca2+-induced Movement of Tropomyosin on Native Cardiac Thin Filaments - "OPEN" state
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 11.0 Å

3667

5nol

EMDB-3667, PDB-5nol:
Ca2+-induced Movement of Tropomyosin on Native Cardiac Thin Filaments - "Closed" state
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 8.0 Å

化合物

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン二リン酸

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

由来
  • sus scrofa (ブタ)
  • Pig (ブタ)
キーワードMOTOR PROTEIN (モータータンパク質) / F-actin (アクチン) / tropomyosin (トロポミオシン)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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