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タイトルRapidly acquired HIV-1 neutralization breadth in a rhesus V2 apex knockin mouse model after a single bolus immunization.
ジャーナル・号・ページSci Immunol, Vol. 11, Issue 116, Page eadz5064, Year 2026
掲載日2026年2月13日
著者Amrit Raj Ghosh / Rumi Habib / Nitesh Mishra / Ryan S Roark / Madhav Akauliya / Ali A Albowaidey / Joel D Allen / Khaled Amereh / Gabriel Avillion / Maria Bottermann / Bo Liang / Namit Chaudhary / Sean Callaghan / Jonathan Dye / Xuduo Li / Jordan R Ellis-Pugh / Rohan Roy Chowdhury / Nicole E James / Xiaotie Liu / Laura Maiorino / Paula M Villavicencio / Rebecca Nedellec / Prabhgun Oberoi / Kirsten J Sowers / Younghoon Park / Thavaleak Prum / Linette Rodriguez / Maria Ssozi / Jonathan L Torres / Agnes A Walsh / John E Warner / Stephanie R Weldon / Liling Xu / Kevin Wiehe / Max Crispin / Andrew B Ward / Usha Nair / Beatrice H Hahn / Dennis R Burton / Lawrence Shapiro / Peter D Kwong / Darrell J Irvine / Raiees Andrabi / George M Shaw / Facundo D Batista /
PubMed 要旨Current immunization strategies to elicit broadly neutralizing antibodies (bnAbs) against HIV-1 generally propose complex, multiboost regimens. In rhesus macaques, simian-human immunodeficiency virus ...Current immunization strategies to elicit broadly neutralizing antibodies (bnAbs) against HIV-1 generally propose complex, multiboost regimens. In rhesus macaques, simian-human immunodeficiency virus (SHIV) infection rapidly drives the development of some bnAb classes sharing structural similarities with those in humans. Here, we generated a knockin (KI) mouse model with B cells bearing the unmutated common ancestor of a V2 apex-targeted bnAb lineage, V033-a. A single immunization with a germline-targeting native-like trimer, Q23-APEX-GT1, recapitulated the ontogeny of the mature rhesus bnAb in KI mice, including rare, disfavored somatic mutations. Resulting antibodies exhibited potent neutralization against a broad panel of heterologous HIV-1 strains. Boosting with Env escape mutant trimers further improved breadth and potency, and cryo-electron microscopy analysis revealed the structural basis for heterologous neutralization breadth. Nonhuman primate and mouse models combined with structure can serve as a platform for identifying and validating immunogens that streamline HIV vaccination regimens.
リンクSci Immunol / PubMed:41686913
手法EM (単粒子)
解像度3.1 - 3.8 Å
構造データ

70663

9oog

EMDB-70663, PDB-9oog:
Cryo-EM structure of vaccine-elicited antibody T3_NB_G05 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT1.N187S
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

70664

9ook

EMDB-70664, PDB-9ook:
Cryo-EM structure of vaccine-elicited antibody T3_QB_G12 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

70666

9oom

EMDB-70666, PDB-9oom:
Cryo-EM structure of vaccine-elicited antibody T6_P_H03 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

由来
  • Macaca mulatta (アカゲザル)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • homo sapiens (ヒト)
  • Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
  • human immunodeficiency virus type 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / immune complex / neutralizing antibody / V2 apex / mouse model / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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