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タイトルDiscovery and molecular mechanism of potent neutralizing antibody from humanized mice with respiratory syncytial virus.
ジャーナル・号・ページPLoS Pathog, Vol. 21, Issue 11, Page e1013674, Year 2025
掲載日2025年11月17日
著者Zheng Zhang / Rui Feng / Long Zhang / Qi Yang / Xuehua Chen / Xiaoxiao Wang / Cui Nie / Wei Peng / Xiangxi Wang / Ling Zhu / Yu Guo / Zixian Sun /
PubMed 要旨Respiratory syncytial virus (RSV) is a leading cause of lower respiratory tract infections among infants and older adults, posing a significant threat to global public health. The prophylactic use of ...Respiratory syncytial virus (RSV) is a leading cause of lower respiratory tract infections among infants and older adults, posing a significant threat to global public health. The prophylactic use of neutralizing antibodies (nAbs) underscores the need to understand elite RSV antibody neutralization mechanisms, which is fundamental for developing next-generation therapies with enhanced potency and broader activity. In this study, we utilized H2L2 transgenic mice encoding human immunoglobulin variable regions for immunization and successfully screened multiple antibodies with significant neutralizing activity using the Beacon Optofluidic system. One of these antibodies, PR306007, exhibited significantly superior broad-spectrum neutralization against both RSV-A and B subgroups. Cryo-electron microscopy (Cryo-EM) structural analysis revealed that PR306007 binds to a unique epitope that overlaps with antigenic sites II and V of the F protein, with its primary binding regions located at the base of the α6 and α7 helices of site II, and residues S173 and N175 of site V. This binding mode offers valuable insights into enhanced neutralization activity and potentially reduces the risk of emerging immune evasive mutants. Furthermore, PR306007 showed potent in vivo antiviral activity against RSV infection and demonstrated good efficacy against both lower and upper respiratory tract infections, making it a promising prophylactic candidate for broad prevention. These findings provide new insights for the future development of RSV vaccines or nAbs.
リンクPLoS Pathog / PubMed:41248206 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度4.08 Å
構造データ

63931

9u74

EMDB-63931, PDB-9u74:
Respiratory Syncytial Virus pre-F trimer bound by neutralizing antibody PR306007
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.08 Å

由来
  • Respiratory syncytial virus (ウイルス)
  • respiratory syncytial virus a2 (ウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードSTRUCTURAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / RSV / pre-F / neutralizing antibody / IMMUNE SYSTEM (includes antibodies / antigens) / STRUCTURAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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