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タイトルAnti-Idiotypic Antibody as a Booster Vaccine Against Respiratory Syncytial Virus.
ジャーナル・号・ページVaccines (Basel), Vol. 13, Issue 1, Year 2025
掲載日2025年1月2日
著者Shreya Mukhopadhyay / Ioannis Manolaridis / Christopher Warren / Aimin Tang / Gregory O'Donnell / Bin Luo / Ryan P Staupe / Kalpit A Vora / Zhifeng Chen /
PubMed 要旨 The respiratory syncytial virus (RSV) is a major cause of lower respiratory tract infections in children and adults. With nearly everyone infected by the age of five, there is an opportunity to ... The respiratory syncytial virus (RSV) is a major cause of lower respiratory tract infections in children and adults. With nearly everyone infected by the age of five, there is an opportunity to develop booster vaccines that enhance B-cell immunity, promoting potent and broadly neutralizing antibodies. One potential approach involves using anti-idiotypic antibodies (anti-IDs) to mimic specific antigenic sites and enhance preexisting immunity in an epitope-specific manner. RB1, a monoclonal antibody (mAb) that binds to site IV of the RSV fusion (RSV F) protein, is a potent and broadly neutralizing against RSV A and B viruses. It is the precursor for MK1654 (clesrovimab), which successfully completed a Phase III clinical trial. In this study, we isolated two anti-IDs, 1A6 and 1D4, targeting RB1 CDR regions, demonstrating that 1A6 competes fully with RSV F in binding to RB1. We resolved the RB1-1A6 and RB1-1D4 Fab-Fab complex structures and proved that 1A6 mimics the RSV F site IV better than 1D4. In an immunogenicity study, mice primed with RSV F and boosted with 1A6 Fab showed a site IV-specific antibody response with a concurrent increase in RSV virus neutralization. These results suggest that anti-IDs could be potentially used as booster vaccines for specific epitopes.
リンクVaccines (Basel) / PubMed:39852814 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.67 - 3.79 Å
構造データ

48393

9mml

EMDB-48393, PDB-9mml:
RB1 Fab bound to 1A6 anti-idiotype Fab
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.67 Å

48404

9mmv

EMDB-48404, PDB-9mmv:
RB1 Fab bound to 1D4 anti-idiotype Fab
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.79 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードIMMUNE SYSTEM / Fab anti idiotype RSV

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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