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タイトルDual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 low pathogenicity avian influenza virus.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 15, Issue 1, Page 10012, Year 2024
掲載日2024年11月19日
著者Ju Sun / Tianyi Zheng / Mingjun Jia / Yanjun Wang / Jingru Yang / Yun Liu / Pengyun Yang / Yufeng Xie / Honglei Sun / Qi Tong / Jiaming Li / Jing Yang / Guanghua Fu / Yi Shi / Jianxun Qi / Wenjun Liu / Jinhua Liu / Wen-Xia Tian / George F Gao / Yuhai Bi /
PubMed 要旨The 1957 H2N2 influenza pandemic virus [A(H2N2)pdm1957] has disappeared from humans since 1968, while H2N2 avian influenza viruses (AIVs) are still circulating in birds. It is necessary to reveal the ...The 1957 H2N2 influenza pandemic virus [A(H2N2)pdm1957] has disappeared from humans since 1968, while H2N2 avian influenza viruses (AIVs) are still circulating in birds. It is necessary to reveal the recurrence risk and potential cross-species infection of these AIVs from avian to mammals. We find that H2 AIVs circulating in domestic poultry in China have genetic and antigenic differences compared to the A(H2N2)pdm1957. One H2N2 AIV has a dual receptor-binding property similar to that of the A(H2N2)pdm1957. Molecular and structural studies reveal that the N144S, and N144E or R137M substitutions in hemagglutinin (HA) enable H2N2 avian or human viruses to bind or preferentially bind human-type receptor. The H2N2 AIV rapidly adapts to mice (female) and acquires mammalian-adapted mutations that facilitated transmission in guinea pigs and ferrets (female). These findings on the receptor-binding, infectivity, transmission, and mammalian-adaptation characteristics of H2N2 AIVs provide a reference for early-warning and prevention for this subtype.
リンクNat Commun / PubMed:39562538 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.31 - 2.87 Å
構造データ

EMDB-38311, PDB-8xg1:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.53 Å

EMDB-38348, PDB-8xhe:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.64 Å

EMDB-38349, PDB-8xhf:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.39 Å

EMDB-38350, PDB-8xhg:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.54 Å

EMDB-38351, PDB-8xhh:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.38 Å

EMDB-38597, PDB-8xr7:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.62 Å

EMDB-38598, PDB-8xr8:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.53 Å

EMDB-38599, PDB-8xr9:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-38600, PDB-8xra:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.31 Å

EMDB-38601, PDB-8xrb:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.49 Å

EMDB-38602, PDB-8xrc:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.5 Å

EMDB-38603, PDB-8xrd:
Dual receptor-binding, infectivity, and transmissibility of an emerging H2N2 avian influenza virus
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.87 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

ChemComp-SIA:
N-acetyl-alpha-neuraminic acid / N-アセチル-α-ノイラミン酸

由来
  • influenza a virus (strain a/korea/426/1968 h2n2) (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN / H2N2 / influenza virus / receptor / replication / transmission / mice / guinea pig / ferret / mutation / public health risk / VIRUS

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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