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タイトルFAM72A degrades UNG2 through the GID/CTLH complex to promote mutagenic repair during antibody maturation.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 15, Issue 1, Page 7541, Year 2024
掲載日2024年8月30日
著者Philip Barbulescu / Chetan K Chana / Matthew K Wong / Ines Ben Makhlouf / Jeffrey P Bruce / Yuqing Feng / Alexander F A Keszei / Cassandra Wong / Rukshana Mohamad-Ramshan / Laura C McGary / Mohammad A Kashem / Derek F Ceccarelli / Stephen Orlicky / Yifei Fang / Huihui Kuang / Mohammad Mazhab-Jafari / Rossanna C Pezo / Ashok S Bhagwat / Trevor J Pugh / Anne-Claude Gingras / Frank Sicheri / Alberto Martin /
PubMed 要旨A diverse antibody repertoire is essential for humoral immunity. Antibody diversification requires the introduction of deoxyuridine (dU) mutations within immunoglobulin genes to initiate somatic ...A diverse antibody repertoire is essential for humoral immunity. Antibody diversification requires the introduction of deoxyuridine (dU) mutations within immunoglobulin genes to initiate somatic hypermutation (SHM) and class switch recombination (CSR). dUs are normally recognized and excised by the base excision repair (BER) protein uracil-DNA glycosylase 2 (UNG2). However, FAM72A downregulates UNG2 permitting dUs to persist and trigger SHM and CSR. How FAM72A promotes UNG2 degradation is unknown. Here, we show that FAM72A recruits a C-terminal to LisH (CTLH) E3 ligase complex to target UNG2 for proteasomal degradation. Deficiency in CTLH complex components result in elevated UNG2 and reduced SHM and CSR. Cryo-EM structural analysis reveals FAM72A directly binds to MKLN1 within the CTLH complex to recruit and ubiquitinate UNG2. Our study further suggests that FAM72A hijacks the CTLH complex to promote mutagenesis in cancer. These findings show that FAM72A is an E3 ligase substrate adaptor critical for humoral immunity and cancer development.
リンクNat Commun / PubMed:39215025 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.27 - 12.0 Å
構造データ

41612

8ttq

EMDB-41612, PDB-8ttq:
Cryo-EM structure of the inner MKLN1 dimer from an autoinhibited MKLN1 tetramer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.27 Å

EMDB-45088: Cryo-EM structure of an autoinhibited MKLN1 tetramer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.59 Å

EMDB-45138: Cryo-EM structure of CTLH-MKLN1-FAM72A in complex with UNG2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 12.0 Å

EMDB-45186: Cryo-EM structure of a FAM72A-MKLN1-RANBP9-TWA1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.8 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードLIGASE / E3 ubiquitin ligase / CTLH complex / substrate adapter recruitment / PROTEIN BINDING

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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