[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルRecognition of methamphetamine and other amines by trace amine receptor TAAR1.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 624, Issue 7992, Page 663-671, Year 2023
掲載日2023年11月7日
著者Heng Liu / You Zheng / Yue Wang / Yumeng Wang / Xinheng He / Peiyu Xu / Sijie Huang / Qingning Yuan / Xinyue Zhang / Ling Wang / Kexin Jiang / Hong Chen / Zhen Li / Wenbin Liu / Sheng Wang / H Eric Xu / Fei Xu /
PubMed 要旨Trace amine-associated receptor 1 (TAAR1), the founding member of a nine-member family of trace amine receptors, is responsible for recognizing a range of biogenic amines in the brain, including the ...Trace amine-associated receptor 1 (TAAR1), the founding member of a nine-member family of trace amine receptors, is responsible for recognizing a range of biogenic amines in the brain, including the endogenous β-phenylethylamine (β-PEA) as well as methamphetamine, an abused substance that has posed a severe threat to human health and society. Given its unique physiological role in the brain, TAAR1 is also an emerging target for a range of neurological disorders including schizophrenia, depression and drug addiction. Here we report structures of human TAAR1-G-protein complexes bound to methamphetamine and β-PEA as well as complexes bound to RO5256390, a TAAR1-selective agonist, and SEP-363856, a clinical-stage dual agonist for TAAR1 and serotonin receptor 5-HTR (refs. ). Together with systematic mutagenesis and functional studies, the structures reveal the molecular basis of methamphetamine recognition and underlying mechanisms of ligand selectivity and polypharmacology between TAAR1 and other monoamine receptors. We identify a lid-like extracellular loop 2 helix/loop structure and a hydrogen-bonding network in the ligand-binding pockets, which may contribute to the ligand recognition in TAAR1. These findings shed light on the ligand recognition mode and activation mechanism for TAAR1 and should guide the development of next-generation therapeutics for drug addiction and various neurological disorders.
リンクNature / PubMed:37935377
手法EM (単粒子)
解像度2.6 - 3.0 Å
構造データ

37347

8w87

EMDB-37347, PDB-8w87:
Cryo-EM structure of the METH-TAAR1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

37348

8w88

EMDB-37348, PDB-8w88:
Cryo-EM structure of the SEP363856-bound TAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

37349

8w89

EMDB-37349, PDB-8w89:
Cryo-EM structure of the PEA-bound TAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

37350

8w8a

EMDB-37350, PDB-8w8a:
Cryo-EM structure of the RO5256390-TAAR1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

37351

8w8b

EMDB-37351, PDB-8w8b:
Cryo-EM structure of SEP-363856 bounded serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gi protein complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

化合物

ChemComp-B40:
(2S)-N-methyl-1-phenylpropan-2-amine / メタンフェタミン

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル

ChemComp-UJL:
1-[(7~{S})-5,7-dihydro-4~{H}-thieno[2,3-c]pyran-7-yl]-~{N}-methyl-methanamine

ChemComp-PEA:
2-PHENYLETHYLAMINE / フェネチルアンモニウム / alkaloid*YM

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-T5U:
(4S)-4-[(2S)-2-phenylbutyl]-1,3-oxazolidin-2-imine

ChemComp-PLM:
PALMITIC ACID / パルミチン酸

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • lama glama (ラマ)
  • escherichia coli (大腸菌)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / TAAR1 / METH / GPCR / SEP-363856 / antipsychotics / PEA / R05256390 / 5-HT1A / SEP363856

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る