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タイトルA combined adjuvant approach primes robust germinal center responses and humoral immunity in non-human primates.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 14, Issue 1, Page 7107, Year 2023
掲載日2023年11月4日
著者Ivy Phung / Kristen A Rodrigues / Ester Marina-Zárate / Laura Maiorino / Bapi Pahar / Wen-Hsin Lee / Mariane Melo / Amitinder Kaur / Carolina Allers / Marissa Fahlberg / Brooke F Grasperge / Jason P Dufour / Faith Schiro / Pyone P Aye / Paul G Lopez / Jonathan L Torres / Gabriel Ozorowski / Saman Eskandarzadeh / Michael Kubitz / Erik Georgeson / Bettina Groschel / Rebecca Nedellec / Michael Bick / Katarzyna Kaczmarek Michaels / Hongmei Gao / Xiaoying Shen / Diane G Carnathan / Guido Silvestri / David C Montefiori / Andrew B Ward / Lars Hangartner / Ronald S Veazey / Dennis R Burton / William R Schief / Darrell J Irvine / Shane Crotty /
PubMed 要旨Adjuvants and antigen delivery kinetics can profoundly influence B cell responses and should be critically considered in rational vaccine design, particularly for difficult neutralizing antibody ...Adjuvants and antigen delivery kinetics can profoundly influence B cell responses and should be critically considered in rational vaccine design, particularly for difficult neutralizing antibody targets such as human immunodeficiency virus (HIV). Antigen kinetics can change depending on the delivery method. To promote extended immunogen bioavailability and to present antigen in a multivalent form, native-HIV Env trimers are modified with short phosphoserine peptide linkers that promote tight binding to aluminum hydroxide (pSer:alum). Here we explore the use of a combined adjuvant approach that incorporates pSer:alum-mediated antigen delivery with potent adjuvants (SMNP, 3M-052) in an extensive head-to-head comparison study with conventional alum to assess germinal center (GC) and humoral immune responses. Priming with pSer:alum plus SMNP induces additive effects that enhance the magnitude and persistence of GCs, which correlate with better GC-T cell help. Autologous HIV-neutralizing antibody titers are improved in SMNP-immunized animals after two immunizations. Over 9 months after priming immunization of pSer:alum with either SMNP or 3M-052, robust Env-specific bone marrow plasma cells (BM B) are observed. Furthermore, pSer-modification of Env trimer reduce targeting towards immunodominant non-neutralizing epitopes. The study shows that a combined adjuvant approach can augment humoral immunity by modulating immunodominance and shows promise for clinical translation.
リンクNat Commun / PubMed:37925510 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度25.0 - 30.0 Å
構造データ

EMDB-40242: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NJ85 wk12 gp120GH, N611/FP, and base epitope polyclonal antibodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 30.0 Å

EMDB-40243: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NJ86 wk12 V1V3, C3V5, N611/FP, and base epitope polyclonal antibodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-40244: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NJ76 wk12 C3V5, N611/FP, and base epitope polyclonal antibodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-40252: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NK04 wk12 gp120 glycan hole and base epitope polyclonal antibodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 28.0 Å

EMDB-40254: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NJ75 wk12 gp120 glycan hole and base epitope polyclonal antibodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 28.0 Å

EMDB-40255: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NJ87 wk12 C3V5 and base epitope polyclonal antibodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 28.0 Å

EMDB-40256: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NJ84 wk12 V1V3, gp120 glycan hole and base epitope polyclonal antibodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 28.0 Å

EMDB-40257: BG505 MD39 SOSIP in complex with Rh.NJ77 wk12 V1V3, C3V5, N611/FP and base epitope polyclonal
手法: EM (単粒子) / 解像度: 28.0 Å

由来
  • Macaca mulatta (アカゲザル)
  • Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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