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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Fragment-Based Discovery of a Novel, Brain Penetrant, Orally Active HDAC2 Inhibitor.
ジャーナル・号・ページ	Acs Med. Chem. Lett., Vol. 13, Page 1591-1597, Year 2022
掲載日	2022年5月25日 (構造データの登録日)
著者	Tamanini, E. / Miyamura, S. / Buck, I.M. / Cons, B.D. / Dawson, L. / East, C. / Futamura, T. / Goto, S. / Griffiths-Jones, C. / Hashimoto, T. ...Tamanini, E. / Miyamura, S. / Buck, I.M. / Cons, B.D. / Dawson, L. / East, C. / Futamura, T. / Goto, S. / Griffiths-Jones, C. / Hashimoto, T. / Heightman, T.D. / Ishikawa, S. / Ito, H. / Kaneko, Y. / Kawato, T. / Kondo, K. / Kurihara, N. / McCarthy, J.M. / Mori, Y. / Nagase, T. / Nakaishi, Y. / Reeks, J. / Sato, A. / Schopf, P. / Tai, K. / Tamai, T. / Tisi, D. / Woolford, A.J.
リンク	Acs Med. Chem. Lett. / PubMed:36262388
手法	X線回折
解像度	1.52 - 2.168 Å
構造データ	PDB-7zzo: HDAC2 in complex with an inhibitor 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2 Å PDB-7zzp: Structure of HDAC2 complexed with an inhibitory ligand 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.52 Å PDB-7zzr: HDAC2 in complex with inhibitory ligand 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.168 Å PDB-7zzs: HDAC2 complexed with an inhibitory ligand 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.88 Å PDB-7zzt: Ligand binding to HDAC2 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.56 Å PDB-7zzu: Inhibitory Ligand binding to HDAC2 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.85 Å PDB-7zzw: Ligand binding to HDAC2 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.73 Å PDB-8a0b: Inhibitor binding to HDAC2 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.746 Å
化合物	ChemComp-ZN: Unknown entry ChemComp-CA: Unknown entry / カルシウムジカチオン ChemComp-NA: Unknown entry / ナトリウムカチオン ChemComp-KIZ: [(2~{R})-1-(dimethylamino)-3-(4-fluorophenyl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]azanium ChemComp-PG4: TETRAETHYLENE GLYCOL / テトラエチレングリコ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-PEG: DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル ChemComp-KZF: 2-(cyclohexylazaniumyl)ethanesulfonate / 2-(シクロヘキシルアミノ)エタンスルホン酸 / pH緩衝剤YM ChemComp-HOH: WATER ChemComp-PGE: TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル ChemComp-EDO: 1,2-ETHANEDIOL / エチレングリコ-ル ChemComp-KJ6: 6-methyl-4-oxidanyl-pyran-2-one / 4-ヒドロキシ-6-メチル-2H-ピラン-2-オン ChemComp-2OP: (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID / L-乳酸 ChemComp-NHE: 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID / 2-(シクロヘキシルアミノ)エタンスルホン酸 / pH緩衝剤YM ChemComp-DMS: DIMETHYL SULFOXIDE / 2-チアプロパン2-オキシド / DMSO, 沈殿剤YM ChemComp-KJN: [(2~{R})-1-(dimethylamino)-1-oxidanylidene-4-phenyl-butan-2-yl]azanium ChemComp-SHH: OCTANEDIOIC ACID HYDROXYAMIDE PHENYLAMIDE / ボリノスタット ChemComp-KK0: (5~{S})-5-(4-chlorophenyl)pyrrolidin-2-one ChemComp-KJF: [(2~{R})-1-oxidanylidene-4-phenyl-1-pyrrolidin-1-yl-butan-2-yl]azanium ChemComp-KKI: 2-[4-[(2~{R},4~{S})-4-phenylpyrrolidin-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]pyridine-3-carbonitrile ChemComp-KKW: [(2~{R},4~{S})-4-(3-chlorophenyl)pyrrolidin-2-yl]-(4-thieno[2,3-c]pyridin-7-ylpiperazin-1-yl)methanone ChemComp-KRU: 1,3-dihydroisoindol-2-yl-[(2R,4S)-4-phenylpyrrolidin-1-ium-2-yl]methanone
由来	homo sapiens (ヒト)
キーワード	TRANSCRIPTION / histone deacetylase / chromatin binding / protein complex / transcription regulation / Deacetylase / transcription regulator / protein de-acetylation / deactylase activity / cell cycle progression / protein deacetylation / transcriptional repressor complex