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Structure paper

タイトルElastic properties and shape of the Piezo dome underlying its mechanosensory function.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 119, Issue 40, Page e2208034119, Year 2022
掲載日2022年10月4日
著者Christoph A Haselwandter / Yusong R Guo / Ziao Fu / Roderick MacKinnon /
PubMed 要旨We show in the companion paper that the free membrane shape of lipid bilayer vesicles containing the mechanosensitive ion channel Piezo can be predicted, with no free parameters, from membrane ...We show in the companion paper that the free membrane shape of lipid bilayer vesicles containing the mechanosensitive ion channel Piezo can be predicted, with no free parameters, from membrane elasticity theory together with measurements of the protein geometry and vesicle size [C. A. Haselwandter, Y. R. Guo, Z. Fu, R. MacKinnon, , 10.1073/pnas.2208027119 (2022)]. Here we use these results to determine the force that the Piezo dome exerts on the free membrane and hence, that the free membrane exerts on the Piezo dome, for a range of vesicle sizes. From vesicle shape measurements alone, we thus obtain a force-distortion relationship for the Piezo dome, from which we deduce the Piezo dome's intrinsic radius of curvature, [Formula: see text] nm, and bending stiffness, [Formula: see text], in freestanding lipid bilayer membranes mimicking cell membranes. Applying these estimates to a spherical cap model of Piezo embedded in a lipid bilayer, we suggest that Piezo's intrinsic curvature, surrounding membrane footprint, small stiffness, and large area are the key properties of Piezo that give rise to low-threshold, high-sensitivity mechanical gating.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:36166476 / PubMed Central
手法EM (トモグラフィー)
構造データ

EMDB-27567: Tomogram of Piezo1 vesicles
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-27568: Tomogram of Piezo1 vesicles
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-27569: Tomogram of Piezo1 vesicles
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-27570: Tomogram of Piezo1 vesicles
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-27571: Tomogram of Piezo1 vesicles
手法: EM (トモグラフィー)

由来
  • Mus (ネズミ)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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