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タイトルMembrane Remodeling and Matrix Dispersal Intermediates During Mammalian Acrosomal Exocytosis.
ジャーナル・号・ページFront Cell Dev Biol, Vol. 9, Page 765673, Year 2021
掲載日2021年12月10日
著者Miguel Ricardo Leung / Ravi Teja Ravi / Bart M Gadella / Tzviya Zeev-Ben-Mordehai /
PubMed 要旨To become fertilization-competent, mammalian sperm must undergo a complex series of biochemical and morphological changes in the female reproductive tract. These changes, collectively called ...To become fertilization-competent, mammalian sperm must undergo a complex series of biochemical and morphological changes in the female reproductive tract. These changes, collectively called capacitation, culminate in the exocytosis of the acrosome, a large vesicle overlying the nucleus. Acrosomal exocytosis is not an all-or-nothing event but rather a regulated process in which vesicle cargo disperses gradually. However, the structural mechanisms underlying this controlled release remain undefined. In addition, unlike other exocytotic events, fusing membranes are shed as vesicles; the cell thus loses the entire anterior two-thirds of its plasma membrane and yet remains intact, while the remaining nonvesiculated plasma membrane becomes fusogenic. Precisely how cell integrity is maintained throughout this drastic vesiculation process is unclear, as is how it ultimately leads to the acquisition of fusion competence. Here, we use cryoelectron tomography to visualize these processes in unfixed, unstained, fully hydrated sperm. We show that paracrystalline structures within the acrosome disassemble during capacitation and acrosomal exocytosis, representing a plausible mechanism for gradual dispersal of the acrosomal matrix. We find that the architecture of the sperm head supports an atypical membrane fission-fusion pathway that maintains cell integrity. Finally, we detail how the acrosome reaction transforms both the micron-scale topography and the nanoscale protein landscape of the sperm surface, thus priming the sperm for fertilization.
リンクFront Cell Dev Biol / PubMed:34957098 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均)
解像度35.0 Å
構造データ

EMDB-13877: subtomogram average of paracrystalline patches from the acrosome of capacitated boar sperm
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 35.0 Å

由来
  • Sus scrofa (ブタ)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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